RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 TPMTP51580 245 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 COPAP53621 1224 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 NOP14P78316 857 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 MYL7Q01449 175 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 SEMG2Q02383 582 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 GAD2Q05329 585 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 SHBQ15464 509 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 KYAT1Q16773 422 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 GEN1Q17RS7 908 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM215Q68D42 235 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 GRAMD4Q6IC98 578 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 DTHD1Q6ZMT9 781 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 TPGS1Q6ZTW0 290 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 DYMQ7RTS9 669 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 GATAD2AQ86YP4 633 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 CBWD2Q8IUF1 395 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 FMNL3Q8IVF7 1028 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 CD302Q8IX05 232 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 TOP6BLQ8N6T0 577 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 FSIP1Q8NA03 581 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 RHBDD1Q8TEB9 315 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 POMGNT1Q8WZA1 660 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 EXOC4Q96A65 974 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 SDCBP2Q9H190 292 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 SMYD3Q9H7B4 428 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 NMUR1Q9HB89 426 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 PARVGQ9HBI0 331 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPHK2Q9NRA0 654 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 DEC1Q9P2X7 70 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 HMGXB4Q9UGU5 601 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 ODF2LQ9ULJ1 636 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 STARD13Q9Y3M8 1113 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 STON1Q9Y6Q2 735 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 NBASA2RRP1 2371 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 A0A087X0B3 334 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 E2F8A0AVK6 867 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 METTL12A8MUP2 240 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 CACNG3O60359 315 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 NDUFS2O75306 463 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 IL18RAPO95256 599 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 CST3P01034 146 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 KLKB1P03952 638 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 WNT1P04628 370 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 HLA-EP13747 358 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCDC130P13994 396 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 WARSP23381 471 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 HOXD13P35453 343 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 MATKP42679 507 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 TLE3Q04726 772 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCDC173Q0VFZ6 552 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 LY6DQ14210 128 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 ANKRD1Q15327 319 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 VSTM1Q6UX27 236 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 HS2ST1Q7LGA3 356 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF720Q7Z2F6 126 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF605Q86T29 641 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM86AQ8N2M4 240 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 LRRC52Q8N7C0 313 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 SNX19Q92543 992 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 RAD54LQ92698 747 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 FBXO32Q969P5 355 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 DNAJC19Q96DA6 116 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 HPDLQ96IR7 371 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 TSPAN18Q96SJ8 248 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 KIF2CQ99661 725 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 BBS2Q9BXC9 721 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 MTG2Q9H4K7 406 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 EBF2Q9HAK2 575 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 CDH9Q9ULB4 789 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 PMS2P1A4D2B8 440 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 J3QKU1 62 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 CASC3O15234 703 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 FLRT2O43155 660 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 CYP26A1O43174 497 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 BRINP1O60477 761 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF217O75362 1048 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 CER1O95813 267 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF883P0CG24 379 aa5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms