RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377095.9

SLC25A39-202, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,565 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-202ENST00000377095 SYT11Q9BT88 431 aa20.11■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 EPHX3Q9H6B9 360 aa20.11■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa20.11■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 MYOFQ9NZM1 2061 aa20.11■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 LEFTY2O00292 366 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 MDM4O15151 490 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 RALAP11233 206 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 GDI1P31150 447 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 PLCB2Q00722 1185 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 FMNL3Q8IVF7 1028 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 CPLX3Q8WVH0 158 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 NOX5Q96PH1 765 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 AGPAT1Q99943 283 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 GKN1Q9NS71 199 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 SMPD4Q9NXE4 827 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 COL4A2P08572 1712 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 CHADO15335 359 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 ERBB2P04626 1255 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 FYNP06241 537 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 CCDC172P0C7W6 258 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 UNGP13051 313 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 PRKCIP41743 596 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 ZBED6P86452 979 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 C10orf120Q5SQS8 335 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 IER5LQ5T953 404 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 SFMBT2Q5VUG0 894 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 BTBD8Q5XKL5 378 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 CPA5Q8WXQ8 436 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 ASIC4Q96FT7 647 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 ZFYVE19Q96K21 471 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 ABCC13Q9NSE7 274 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 LTFP02788 710 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 GABRB2P47870 512 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 MTF1Q14872 753 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 ASIC2Q16515 512 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 NAA35Q5VZE5 725 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 TADA2BQ86TJ2 420 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 EDEM1Q92611 657 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 WBP2Q969T9 261 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 FAM83CQ9BQN1 747 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 TRIM5Q9C035 493 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 DNMT3LQ9UJW3 386 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC25A39-202ENST00000377095 WDFY4Q6ZS81 3184 aa20.08■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 FAM170AA1A519 330 aa20.08■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 ZNF263O14978 683 aa20.08■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 SART1O43290 800 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 CASP14P31944 242 aa20.08■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 SIGLEC14Q08ET2 396 aa20.08■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 TAF5Q15542 800 aa20.08■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa20.08■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 TRIM72Q6ZMU5 477 aa20.08■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa20.08■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 YAF2Q8IY57 180 aa20.08■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 IRF7Q92985 503 aa20.08■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 NACA2Q9H009 215 aa20.08■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 HAUS4Q9H6D7 363 aa20.08■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 BRD9Q9H8M2 597 aa20.08■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 TRPV5Q9NQA5 729 aa20.08■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 WNT16Q9UBV4 365 aa20.08■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 GREM1O60565 184 aa20.07■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 EFEMP1Q12805 493 aa20.07■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa20.07■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 HGSNATQ68CP4 663 aa20.07■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 OLFML1Q6UWY5 402 aa20.07■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 TRIM67Q6ZTA4 783 aa20.07■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 BEND5Q7L4P6 421 aa20.07■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 ERICH1Q86X53 443 aa20.07■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 KIAA1958Q8N8K9 716 aa20.07■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 C18orf8Q96DM3 657 aa20.07■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 CFAP97Q9P2B7 532 aa20.07■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 SKILP12757 684 aa20.06■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 MMP8P22894 467 aa20.06■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 SNX16P57768 344 aa20.06■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 CENPCQ03188 943 aa20.06■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 C2CD6Q53TS8 623 aa20.06■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 OR6B2Q6IFH4 312 aa20.06■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 MSANTD2Q6P1R3 559 aa20.06■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 MIB1Q86YT6 1006 aa20.06■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 TTC16Q8NEE8 873 aa20.06■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 SLC30A5Q8TAD4 765 aa20.06■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 OSCP1Q8WVF1 389 aa20.06■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 DNASE1L2Q92874 299 aa20.06■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 LINC00597Q9H2U6 94 aa20.06■□□□□ 0.8
SLC25A39-202ENST00000377095 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms