RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 CCR2P41597 374 aa30.98■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP30.98■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 C3orf20Q8ND61 904 aa30.98■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 FAM149B1Q96BN6 582 aa30.98■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP30.98■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa30.98■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 TFR2Q9UP52 801 aa30.98■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 BRWD1Q9NSI6 2320 aa30.98■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 H3BQ06 376 aaPredicted RBP30.98■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 GRAP2O75791 330 aa30.98■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa30.98■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 GPC5P78333 572 aa30.98■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 SLC5A9Q2M3M2 681 aa30.98■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 EFHC1Q5JVL4 640 aa30.98■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP30.98■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP30.98■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 DNAI1Q9UI46 699 aa30.98■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 A0A1W2PRU2 124 aa30.97■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa30.97■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF840PA6NDX5 716 aa30.97■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 FGF19O95750 216 aa30.97■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 LTFP02788 710 aa30.97■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 GJA1P17302 382 aa30.97■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 CDC25CP30307 473 aa30.97■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 PPP3CCP48454 512 aa30.97■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 BSPRYQ5W0U4 402 aa30.97■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 DNAJC24Q6P3W2 148 aa30.97■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 SLC26A9Q7LBE3 791 aa30.97■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 ARHGAP18Q8N392 663 aa30.97■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP30.97■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 TCEAL4Q96EI5 215 aa30.97■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 ATXN3LQ9H3M9 355 aa30.97■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 OSER1Q9NX31 292 aa30.97■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 CD207Q9UJ71 328 aa30.97■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 DUSP10Q9Y6W6 482 aa30.97■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 GJB6O95452 261 aa30.96■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM253P0C7T8 217 aa30.96■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 KCNA5P22460 613 aa30.96■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 SCNN1AP37088 669 aa30.96■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 PSEN1P49768 467 aa30.96■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 PRSS36Q5K4E3 855 aa30.96■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF569Q5MCW4 686 aa30.96■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 ATAT1Q5SQI0 421 aa30.96■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 SMRP1Q8NCR6 262 aa30.96■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 GOLGA1Q92805 767 aa30.96■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 ARHGEF26Q96DR7 871 aa30.96■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 GCNAQ96QF7 691 aa30.96■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 SELENOOQ9BVL4 669 aa30.96■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
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ECHS1-201ENST00000368547 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
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ECHS1-201ENST00000368547 SHKBP1Q8TBC3 707 aa30.95■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 WDR24Q96S15 920 aa30.95■■■□□ 2.55
ECHS1-201ENST00000368547 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
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ECHS1-201ENST00000368547 ZNF197O14709 1029 aa30.95■■■□□ 2.54
ECHS1-201ENST00000368547 HSF2BPO75031 334 aa30.95■■■□□ 2.54
ECHS1-201ENST00000368547 GLI1P08151 1106 aa30.95■■■□□ 2.54
ECHS1-201ENST00000368547 KRT3P12035 628 aa30.95■■■□□ 2.54
ECHS1-201ENST00000368547 CYP4F8P98187 520 aa30.95■■■□□ 2.54
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ECHS1-201ENST00000368547 SNX30Q5VWJ9 437 aa30.95■■■□□ 2.54
ECHS1-201ENST00000368547 BTBD8Q5XKL5 378 aa30.95■■■□□ 2.54
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF592Q92610 1267 aa30.95■■■□□ 2.54
ECHS1-201ENST00000368547 EDEM1Q92611 657 aa30.95■■■□□ 2.54
ECHS1-201ENST00000368547 HLA-CQ95604 372 aa30.95■■■□□ 2.54
ECHS1-201ENST00000368547 POPDC2Q9HBU9 364 aa30.95■■■□□ 2.54
ECHS1-201ENST00000368547 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.54
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ECHS1-201ENST00000368547 CYP1A2P05177 515 aa30.94■■■□□ 2.54
ECHS1-201ENST00000368547 CASQ1P31415 396 aa30.94■■■□□ 2.54
ECHS1-201ENST00000368547 TRIM58Q8NG06 486 aa30.94■■■□□ 2.54
ECHS1-201ENST00000368547 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
ECHS1-201ENST00000368547 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
ECHS1-201ENST00000368547 RIPOR3Q96MK2 946 aa30.94■■■□□ 2.54
ECHS1-201ENST00000368547 ABCC13Q9NSE7 274 aa30.94■■■□□ 2.54
ECHS1-201ENST00000368547 CLIC5Q9NZA1 410 aa30.94■■■□□ 2.54
ECHS1-201ENST00000368547 SIGLEC16A6NMB1 481 aa30.93■■■□□ 2.54
ECHS1-201ENST00000368547 FYNP06241 537 aa30.93■■■□□ 2.54
ECHS1-201ENST00000368547 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa30.93■■■□□ 2.54
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ECHS1-201ENST00000368547 CLUHO75153 1309 aa30.93■■■□□ 2.54
ECHS1-201ENST00000368547 C5orf42Q9H799 3197 aa30.92■■■□□ 2.54
ECHS1-201ENST00000368547 MACROD2A1Z1Q3 448 aa30.92■■■□□ 2.54
ECHS1-201ENST00000368547 RARGP13631 454 aa30.92■■■□□ 2.54
ECHS1-201ENST00000368547 SLC35F6Q8N357 371 aa30.92■■■□□ 2.54
ECHS1-201ENST00000368547 JOSD2Q8TAC2 188 aa30.92■■■□□ 2.54
ECHS1-201ENST00000368547 ITFG1Q8TB96 612 aa30.92■■■□□ 2.54
ECHS1-201ENST00000368547 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
ECHS1-201ENST00000368547 MCEEQ96PE7 176 aa30.92■■■□□ 2.54
ECHS1-201ENST00000368547 CCSER2Q9H7U1 834 aa30.92■■■□□ 2.54
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