RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349984.6

CCR6-202, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 2,980 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-202ENST00000349984 CETN1Q12798 172 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 DPYDQ12882 1025 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 GIT2Q14161 759 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 MOGQ16653 247 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 DGKDQ16760 1214 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 CCDC58Q4VC31 144 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 SGO2Q562F6 1265 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 PRR16Q569H4 304 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 C1orf53Q5VUE5 145 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 NIPAL1Q6NVV3 410 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 KLHDC10Q6PID8 442 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 DTHD1Q6ZMT9 781 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 HS2ST1Q7LGA3 356 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 OR2W6PQ8NHA6 318 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 TTC8Q8TAM2 541 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 LENG9Q96B70 501 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 ZMYND12Q9H0C1 365 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 SIAEQ9HAT2 523 aa7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CCR6-202ENST00000349984 KCNJ18B7U540 433 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 NOP56O00567 594 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 XPOTO43592 962 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 SLC37A4O43826 429 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 F2P00734 622 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 OCM2P0CE71 109 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 GZMAP12544 262 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 PAFAH1B1P43034 410 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 NR2C2P49116 596 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 IST1P53990 364 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 KRT76Q01546 638 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 FPGSQ05932 587 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 ZNF844Q08AG5 666 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 KCNJ12Q14500 433 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 NAALADL2Q58DX5 795 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 DCDC5Q6ZRR9 648 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 CRYGNQ8WXF5 182 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 STAMQ92783 540 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 NXPE3Q969Y0 559 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 MXRA8Q9BRK3 442 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 TXLNGQ9NUQ3 528 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 GGT7Q9UJ14 662 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 FBXL5Q9UKA1 691 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 Q9Y3F1 56 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 MUSKO15146 869 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 AQP9O43315 295 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 ENTPD5O75356 428 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 BAIAP3O94812 1187 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 SUN1O94901 812 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 KLHL2O95198 593 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 FUCA1P04066 466 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 S100A6P06703 90 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 RBP3P10745 1247 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 CLK3P49761 638 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 KCNC4Q03721 635 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 SLC34A1Q06495 639 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 GRM2Q14416 872 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 TCP11X2Q5H9J9 407 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 TMEM240Q5SV17 173 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 FITM2Q8N6M3 262 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 TBCKQ8TEA7 893 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 MS4A14Q96JA4 679 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 DNAJC7Q99615 494 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 CSRNP2Q9H175 543 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 KMT5AQ9NQR1 393 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 LRWD1Q9UFC0 647 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 KCNN3Q9UGI6 736 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 GPSM3Q9Y4H4 160 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 SPEF1Q9Y4P9 236 aa7.52□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 TRIM64A6NGJ6 449 aa7.51□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 TRIM64BA6NI03 449 aa7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms