RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 PSEN1P49768 467 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SLC12A3P55017 1021 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 FANCCQ00597 558 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 BST2Q10589 180 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 GPR17Q13304 367 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CUL2Q13617 745 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 HYIQ5T013 277 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SEL1L2Q5TEA6 688 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 LEKR1Q6ZMV7 388 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 MON1AQ86VX9 555 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 OR5B17Q8NGF7 314 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 LRRC15Q8TF66 581 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 PAAF1Q9BRP4 392 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TM6SF2Q9BZW4 377 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 VANGL2Q9ULK5 521 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 IKBKGQ9Y6K9 419 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SHISA7A6NL88 538 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 F8W8V4 182 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SH3BP5O60239 455 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 MAGEC1O60732 1142 aa4.63□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 ALPPL2P10696 532 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CD44P16070 742 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ATP4AP20648 1035 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 BMP6P22004 513 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 HTR1BP28222 390 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 PSMD8P48556 350 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 FMO5P49326 533 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 IQCB1Q15051 598 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC6Q16204 474 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 DUSP6Q16828 381 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 DGKKQ5KSL6 1271 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 LY6G5CQ5SRR4 150 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 RAP1GAP2Q684P5 730 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM67Q6ZTA4 783 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 FAM35AQ86V20 835 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 PIGZQ86VD9 579 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 FAM131BQ86XD5 332 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 NRSN1Q8IZ57 195 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF366Q8N895 744 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC112Q8NEF3 446 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 MNS1Q8NEH6 495 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 RHBDD1Q8TEB9 315 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 OR8D1Q8WZ84 308 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 KLK6Q92876 244 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 DCUN1D1Q96GG9 259 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SERPINB11Q96P15 392 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CASD1Q96PB1 797 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ACBD6Q9BR61 282 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 GDE1Q9NZC3 331 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 LZTS1Q9Y250 596 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0B4J269 797 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 A8MX80 341 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SNX2O60749 519 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 GPR32O75388 356 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TADA3O75528 432 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 FBXO21O94952 628 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 F9P00740 461 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 LTFP02788 710 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SYPP08247 313 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SETSIPP0DME0 302 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ADH5P11766 374 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 LAMP2P13473 410 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ATP1A3P13637 1013 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SOX9P48436 509 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 POU5F1BQ06416 359 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM68Q6AZZ1 485 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 KIAA1211LQ6NV74 962 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TSSK4Q6SA08 328 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CHST9Q7L1S5 443 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SCUBE3Q8IX30 993 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 PALM2Q8IXS6 379 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TOP6BLQ8N6T0 577 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC89Q8N998 374 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ITFG1Q8TB96 612 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM11Q96F44 468 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 PPP1R16AQ96I34 528 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SNX27Q96L92 541 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 RWDD2AQ9UIY3 292 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CDH22Q9UJ99 828 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SPAG17Q6Q759 2223 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 F5H423 210 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 H3BRJ5 948 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ATG7O95352 703 aa4.62□□□□□ -1.67
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