RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335007.9

PPP1CC-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CC, Length 2,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 CEP170P1Q96L14 293 aa21■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa21■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 APOL6Q9BWW8 343 aa21■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM96AQ9H5X1 160 aa21■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 L1CAMP32004 1257 aa20.99■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 ACOT2P49753 483 aa20.99■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 BMPR2Q13873 1038 aa20.99■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 CYP4A22Q5TCH4 519 aa20.99■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 C1orf228Q6PIY5 440 aa20.99■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 NDUFAF2Q8N183 169 aa20.99■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 SPATA18Q8TC71 538 aa20.99■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 CCPG1Q9ULG6 757 aa20.99■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 ENTPD3O75355 529 aa20.99■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 AVILO75366 819 aa20.99■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 SNAPC2Q13487 334 aa20.99■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 KLHDC10Q6PID8 442 aa20.99■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa20.99■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa20.99■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 UBR7Q8N806 425 aa20.99■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 CMTM5Q96DZ9 223 aa20.99■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 GCNAQ96QF7 691 aa20.99■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 CSRNP1Q96S65 589 aa20.99■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 CGRRF1Q99675 332 aa20.99■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 IMPG2Q9BZV3 1241 aa20.99■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa20.99■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 USP29Q9HBJ7 922 aa20.99■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa20.99■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa20.99■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 TOM1L1O75674 476 aa20.98■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 CCNE2O96020 404 aa20.98■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 TFAP2AP05549 437 aa20.98■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 MTMR2Q13614 643 aa20.98■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 OLFML2BQ68BL8 750 aa20.98■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 KCTD6Q8NC69 237 aa20.98■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 POPDC2Q9HBU9 364 aa20.98■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 DMTF1Q9Y222 760 aa20.98■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa20.98■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa20.98■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC160A6NGH7 325 aa20.98■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 SIN3BO75182 1162 aa20.98■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 CD48P09326 243 aa20.98■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 MAGEA8P43361 318 aa20.98■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 ALDH1A3P47895 512 aa20.98■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 GPAT2Q6NUI2 795 aa20.98■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 FBXW8Q8N3Y1 598 aa20.98■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 HIPK4Q8NE63 616 aa20.98■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 MCPH1Q8NEM0 835 aa20.98■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP20.98■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 CYP4F11Q9HBI6 524 aa20.98■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 FEM1BQ9UK73 627 aa20.98■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa20.98■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 H3BNX3 289 aa20.97■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 MYL4P12829 197 aa20.97■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 OSBPP22059 807 aa20.97■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 NRLP54845 237 aa20.97■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 TLR1Q15399 786 aa20.97■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 SYCP2LQ5T4T6 812 aa20.97■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 KBTBD6Q86V97 674 aa20.97■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa20.97■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 DCUN1D1Q96GG9 259 aa20.97■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 MAML3Q96JK9 1138 aa20.97■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF541Q9H0D2 1346 aa20.97■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 PMLP29590 882 aa20.97■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 MCF2L2Q86YR7 1114 aa20.97■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 DEFB107AQ8IZN7 70 aa20.97■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 FNIP1Q8TF40 1166 aa20.97■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 USP6NLQ92738 828 aa20.97■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 AGBL1Q96MI9 1066 aa20.97■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 RHBDL2Q9NX52 303 aa20.97■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 PAK5Q9P286 719 aa20.97■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 LZTS1Q9Y250 596 aa20.97■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 STYXL1Q9Y6J8 313 aa20.97■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 KAT6AQ92794 2004 aa20.97■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 CAPN8A6NHC0 703 aa20.96■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 NFIBO00712 420 aa20.96■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM189A1O60320 539 aa20.96■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 APOEP02649 317 aa20.96■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 ICAM1P05362 532 aa20.96■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 KRT3P12035 628 aa20.96■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 ITGAXP20702 1163 aa20.96■□□□□ 0.95
PPP1CC-201ENST00000335007 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms