RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000315965.6

CCDC71L-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71 like, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CCDC71L, Length 1,575 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71L-201ENST00000315965 ABCC13Q9NSE7 274 aa25.14■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 GMIPQ9P107 970 aa25.14■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 STAP1Q9ULZ2 295 aa25.14■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 HYOU1Q9Y4L1 999 aa25.14■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 A0A1W2PQH9 124 aa25.13■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 FYNP06241 537 aa25.13■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 PPM1LQ5SGD2 360 aa25.13■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa25.13■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa25.13■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 SCD5Q86SK9 330 aa25.13■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 PDZD8Q8NEN9 1154 aa25.13■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 KIF18AQ8NI77 898 aa25.13■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 OVCA2Q8WZ82 227 aa25.13■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 PPP2R3CQ969Q6 453 aa25.13■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 RRN3Q9NYV6 651 aa25.13■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa25.13■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 USTQ9Y2C2 406 aa25.13■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 TRANK1O15050 2925 aa25.12■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 ENC1O14682 589 aa25.12■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 RNF8O76064 485 aa25.12■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 DUSP6Q16828 381 aa25.12■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 SLC25A52Q3SY17 297 aa25.12■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 ELMOD1Q8N336 334 aa25.12■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 EDEM1Q92611 657 aa25.12■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 NCAPGQ9BPX3 1015 aa25.12■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 NMUR1Q9HB89 426 aa25.12■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 FANCGO15287 622 aa25.11■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 EPCAMP16422 314 aa25.11■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 ATP11AP98196 1134 aa25.11■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 SYPL2Q5VXT5 272 aa25.11■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa25.11■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 TMEM265A0A087WTH1 108 aa25.1■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 ZMYND10O75800 440 aa25.1■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 RPS6KA1Q15418 735 aa25.1■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 CDO1Q16878 200 aa25.1■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 CPNE8Q86YQ8 564 aa25.1■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 NT5C3BQ969T7 300 aa25.1■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 HES6Q96HZ4 224 aa25.1■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 TLR10Q9BXR5 811 aa25.1■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 CLIC5Q9NZA1 410 aa25.1■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 NCK2O43639 380 aa25.1■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 LRCH4O75427 683 aa25.1■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa25.1■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 HOXA9P31269 272 aa25.1■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 PCK1P35558 622 aa25.1■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 SSR1P43307 286 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 NRIP1P48552 1158 aa25.1■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 PGFP49763 221 aa25.1■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 SULT1E1P49888 294 aa25.1■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 STRADAQ7RTN6 431 aa25.1■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 FAM172AQ8WUF8 416 aa25.1■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 NPY6RQ99463 290 aa25.1■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 RALAP11233 206 aa25.09■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 PPP3CCP48454 512 aa25.09■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa25.09■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 UBL4BQ8N7F7 174 aa25.09■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 RNF139Q8WU17 664 aa25.09■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 CD101Q93033 1021 aa25.09■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 TBCBQ99426 244 aa25.09■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 OSER1Q9NX31 292 aa25.09■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa25.08■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 CCDC66A2RUB6 948 aa25.08■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 HADHQ16836 314 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa25.08■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 RHOT1Q8IXI2 618 aa25.08■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa25.08■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa25.08■■□□□ 1.61
CCDC71L-201ENST00000315965 CDH23Q9H251 3354 aa25.08■■□□□ 1.6
CCDC71L-201ENST00000315965 SPDYE4A6NLX3 237 aa25.07■■□□□ 1.6
CCDC71L-201ENST00000315965 M0QYT0 321 aa25.07■■□□□ 1.6
CCDC71L-201ENST00000315965 PSTPIP1O43586 416 aa25.07■■□□□ 1.6
CCDC71L-201ENST00000315965 RARGP13631 454 aa25.07■■□□□ 1.6
CCDC71L-201ENST00000315965 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CCDC71L-201ENST00000315965 CTNNA2P26232 953 aa25.07■■□□□ 1.6
CCDC71L-201ENST00000315965 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CCDC71L-201ENST00000315965 SNX30Q5VWJ9 437 aa25.07■■□□□ 1.6
CCDC71L-201ENST00000315965 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CCDC71L-201ENST00000315965 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CCDC71L-201ENST00000315965 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CCDC71L-201ENST00000315965 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CCDC71L-201ENST00000315965 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP25.07■■□□□ 1.6
CCDC71L-201ENST00000315965 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa25.07■■□□□ 1.6
CCDC71L-201ENST00000315965 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP25.07■■□□□ 1.6
CCDC71L-201ENST00000315965 ZNF840PA6NDX5 716 aa25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms