RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 REEP2Q9BRK0 252 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 BBS2Q9BXC9 721 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 NRSN2Q9GZP1 204 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF38Q9H0F5 515 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 SNX25Q9H3E2 840 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 ITM2CQ9NQX7 267 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 COMMD8Q9NX08 183 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 STYXL1Q9Y6J8 313 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 APC2O95996 2303 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 ANK1P16157 1881 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 SCN1AP35498 2009 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 LAMA1P25391 3075 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 AKAP13Q12802 2813 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM149AA5PLN7 773 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 PP2D1A8MPX8 630 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 PLK4O00444 970 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 YKT6O15498 198 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDHGA12O60330 932 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 CACNG3O60359 315 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 JAK2O60674 1132 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 C1QL1O75973 258 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM163BP0C2L3 166 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 PLCG1P19174 1290 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 GRIA4P48058 902 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF131P52739 623 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 CDH8P55286 799 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 C21orf59P57076 290 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 RILPL1Q5EBL4 403 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 DHRS13Q6UX07 377 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 PHTF2Q8N3S3 785 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM176AQ96HP8 235 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 MMS19Q96T76 1030 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 PKMYT1Q99640 499 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 OSGEPQ9NPF4 335 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 TOR4AQ9NXH8 423 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 ASXL3Q9C0F0 2248 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1B0GVT2 93 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 F8VP50 259 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 RFPL3O75679 317 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 NTRK1P04629 796 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 TYRP14679 529 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 ABCB4P21439 1286 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 WARSP23381 471 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 ITPKBP27987 946 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 IL12RB1P42701 662 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 TMPRSS3P57727 454 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 CXADRP78310 365 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 ZXDBP98169 803 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 GSE1Q14687 1217 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 PTPRNQ16849 979 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNK18Q7Z418 384 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 TADA2BQ86TJ2 420 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM25Q86YD3 366 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 TMPRSS6Q8IU80 811 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 SFTPA1Q8IWL2 248 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 BRSK2Q8IWQ3 736 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 SYCP3Q8IZU3 236 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 C1orf127Q8N9H9 656 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF248Q8NDW4 579 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 CRELD1Q96HD1 420 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 PCED1BQ96HM7 432 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 HPDLQ96IR7 371 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 ACCSQ96QU6 501 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 LGMNQ99538 433 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 PLIN2Q99541 437 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM213AQ9BRX8 229 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXO44Q9H4M3 255 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 FBRSQ9HAH7 460 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 IL21RQ9HBE5 538 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 SEL1LQ9UBV2 794 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF510Q9Y2H8 683 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 RAD54BQ9Y620 910 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 IGSF10Q6WRI0 2623 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 VWA3AA6NCI4 1184 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 B8ZZF3 427 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD63C9JTQ0 380 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 ENC1O14682 589 aa8.33□□□□□ -1.08
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