RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000271628.8

SF3B4-201, Transcript of splicing factor 3b subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SF3B4, Length 2,085 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4-201ENST00000271628 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
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SF3B4-201ENST00000271628 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SF3B4-201ENST00000271628 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SF3B4-201ENST00000271628 FRMPD3Q5JV73 1810 aa15.93■□□□□ 0.14
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SF3B4-201ENST00000271628 BRCC3P46736 316 aa15.93■□□□□ 0.14
SF3B4-201ENST00000271628 BCAR1P56945 870 aa15.93■□□□□ 0.14
SF3B4-201ENST00000271628 MBTPS1Q14703 1052 aa15.93■□□□□ 0.14
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SF3B4-201ENST00000271628 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SF3B4-201ENST00000271628 RAB41Q5JT25 222 aa15.93■□□□□ 0.14
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