RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 PGBD4Q96DM1 585 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 ADAM33Q9BZ11 813 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 AP5M1Q9H0R1 490 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 COL1A2P08123 1366 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 LRRC37AA6NMS7 1700 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 PIK3R2O00459 728 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 CLGNO14967 610 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 PDHA1P08559 390 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 PGAM1P18669 254 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 SERPINB8P50452 374 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 CLCN3P51790 818 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 PRKAA2P54646 552 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 RCN1Q15293 331 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 LY6KQ17RY6 165 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 PTPN20Q4JDL3 420 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 PID1Q7Z2X4 250 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 AFG1LQ8WV93 481 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 JADE3Q92613 823 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 CDT1Q9H211 546 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 PDLIM7Q9NR12 457 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 AP4E1Q9UPM8 1137 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 L3MBTL1Q9Y468 752 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 EPHB2P29323 1055 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 ART3Q13508 389 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 CCDC153Q494R4 210 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 GALNTL6Q49A17 601 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 IRGCQ6NXR0 463 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 KLC3Q6P597 504 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 RMDN2Q96LZ7 410 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 ADAM7Q9H2U9 754 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 AAASQ9NRG9 546 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 CCDC160A6NGH7 325 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 CREB3O43889 395 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 GRAP2O75791 330 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 OAS1P00973 400 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 CDK7P50613 346 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 KDSRQ06136 332 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 POU5F1BQ06416 359 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 OASLQ15646 514 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 SH2D4BQ5SQS7 431 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 GRTP1Q5TC63 336 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 AP1ARQ63HQ0 302 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 LLGL2Q6P1M3 1020 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 CYP4X1Q8N118 509 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 LRGUKQ96M69 825 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 EPAS1Q99814 870 aa9.16□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 MAGEB16A2A368 324 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 NCAM2O15394 837 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 GRIN3BO60391 1043 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 CILPO75339 1184 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 LRCH4O75427 683 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 FBXO21O94952 628 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 NPTXRO95502 500 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 MPOP05164 745 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 TPSB2P20231 275 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 IVDP26440 423 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 TAF6P49848 677 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 COPAP53621 1224 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 TPI1P60174 286 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 PPP2R5DQ14738 602 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 MAPRE2Q15555 327 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 TPSAB1Q15661 275 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 SPANXN3Q5MJ09 141 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 MROH9Q5TGP6 573 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 TMEM154Q6P9G4 183 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 PRUNE1Q86TP1 453 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 EFHD1Q9BUP0 239 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 SMYD3Q9H7B4 428 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 EBF2Q9HAK2 575 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 VTA1Q9NP79 307 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 PFDN4Q9NQP4 134 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 CLEC11AQ9Y240 323 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 LRCH1Q9Y2L9 728 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 A0A1W2PPM1 405 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 SERPINE1P05121 402 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 AXLP30530 894 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 CDK18Q07002 472 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 MGAT5Q09328 741 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 TAS1R3Q7RTX0 852 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 BANPQ8N9N5 519 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 MIEF2Q96C03 454 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 SLC10A4Q96EP9 437 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 PRKAG3Q9UGI9 489 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 ADAM28Q9UKQ2 775 aa9.15□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP9.15□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.1 ms