RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260116.4

TTPA-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPA, Length 2,338 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPA-201ENST00000260116 LLGL1Q15334 1064 aa11.37□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 DNAJC24Q6P3W2 148 aa11.37□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 DCUN1D2Q6PH85 259 aa11.37□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 TRIM72Q6ZMU5 477 aa11.37□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 GPR65Q8IYL9 337 aa11.37□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 DEFB106AQ8N104 65 aa11.37□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 KCTD13Q8WZ19 329 aa11.37□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 PPP2R3CQ969Q6 453 aa11.37□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 SELENOOQ9BVL4 669 aa11.37□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 LRRC3Q9BY71 257 aa11.37□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 PRKD2Q9BZL6 878 aa11.37□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 DNAI2Q9GZS0 605 aa11.37□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 ANAPC7Q9UJX3 599 aa11.37□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 CCL26Q9Y258 94 aa11.37□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa11.37□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa11.37□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 ANKRD62A6NC57 917 aa11.37□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 MOCS3O95396 460 aa11.37□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 CSH1P0DML2 217 aa11.37□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 CSH2P0DML3 217 aa11.37□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 GABRB2P47870 512 aa11.37□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 GPC5P78333 572 aa11.37□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 TEAD2Q15562 447 aa11.37□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 CTC1Q2NKJ3 1217 aa11.37□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 SPATA17Q96L03 361 aa11.37□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 ADAM7Q9H2U9 754 aa11.37□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 ASAH2Q9NR71 780 aa11.37□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 GKN1Q9NS71 199 aa11.37□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 USTQ9Y2C2 406 aa11.37□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 DOCK8Q8NF50 2099 aa11.37□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 TMEM265A0A087WTH1 108 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 ZNF840PA6NDX5 716 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 CAPN9O14815 690 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 TLR5O60602 858 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 LTFP02788 710 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 CCDC175P0C221 793 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 CEBPBP17676 345 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 ARHGAP25P42331 645 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 RPL34P49207 117 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 VAV2P52735 878 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 EFEMP1Q12805 493 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 PM20D1Q6GTS8 502 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 ANKRD54Q6NXT1 300 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 C3orf20Q8ND61 904 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 SHKBP1Q8TBC3 707 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 STK32AQ8WU08 396 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 CASP10Q92851 521 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 MCRS1Q96EZ8 462 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 SLITRK1Q96PX8 696 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 CNGB3Q9NQW8 809 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 MOSPD3O75425 235 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 F11P03951 625 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 IRF1P10914 325 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 PDGFRAP16234 1089 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 GJC1P36383 396 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 MESDQ14696 234 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 SMTNL2Q2TAL5 461 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 C10orf120Q5SQS8 335 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 ELMOD1Q8N336 334 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 RIN3Q8TB24 985 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 RXFP2Q8WXD0 754 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 WBP2Q969T9 261 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 POMKQ9H5K3 350 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 SFXN1Q9H9B4 322 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 PNPLA8Q9NP80 782 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 KLHL11Q9NVR0 708 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 TMEM59LQ9UK28 342 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 SCML2Q9UQR0 700 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 FRYLO94915 3013 aa11.35□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 MYO10Q9HD67 2058 aa11.35□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 COCHO43405 550 aa11.35□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 CALB1P05937 261 aa11.35□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 RARGP13631 454 aa11.35□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 KCNT1Q5JUK3 1230 aa11.35□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa11.35□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 BTBD8Q5XKL5 378 aa11.35□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa11.35□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa11.35□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 BHMTQ93088 406 aa11.35□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 TBCBQ99426 244 aa11.35□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 PSMB7Q99436 277 aa11.35□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 SLC46A2Q9BY10 475 aa11.35□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 NACA2Q9H009 215 aa11.35□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 FBXO44Q9H4M3 255 aa11.35□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 POPDC2Q9HBU9 364 aa11.35□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 ANLNQ9NQW6 1124 aa11.35□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
TTPA-201ENST00000260116 OBSL1O75147 1896 aa11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.5 ms