RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 STILQ15468 1287 aa16.53■□□□□ 0.24
CTIF-201ENST00000256413 TTC7BQ86TV6 843 aa16.53■□□□□ 0.24
CTIF-201ENST00000256413 SCFD2Q8WU76 684 aa16.53■□□□□ 0.24
CTIF-201ENST00000256413 ZNF333Q96JL9 665 aa16.53■□□□□ 0.24
CTIF-201ENST00000256413 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP16.53■□□□□ 0.24
CTIF-201ENST00000256413 NCAPD2Q15021 1401 aa16.53■□□□□ 0.24
CTIF-201ENST00000256413 PCP4L1A6NKN8 68 aa16.53■□□□□ 0.24
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CTIF-201ENST00000256413 NDUFS3O75489 264 aa16.52■□□□□ 0.24
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CTIF-201ENST00000256413 VAC14Q08AM6 782 aa16.52■□□□□ 0.23
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CTIF-201ENST00000256413 TRIM43BA6NCK2 446 aa16.52■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 SNTNA6NMZ2 147 aa16.52■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 STK25O00506 426 aa16.52■□□□□ 0.23
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CTIF-201ENST00000256413 CYP11B1P15538 503 aa16.52■□□□□ 0.23
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CTIF-201ENST00000256413 PI4K2AQ9BTU6 479 aa16.51■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 MAFGO15525 162 aa16.51■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 ZNF235Q14590 738 aa16.51■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 BOLA3Q53S33 107 aa16.51■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 CYP4A22Q5TCH4 519 aa16.51■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 OTOAQ7RTW8 1153 aa16.51■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 SFRP1Q8N474 314 aa16.51■□□□□ 0.23
CTIF-201ENST00000256413 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
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