RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000232888.6

RRP9-201, Transcript of ribosomal RNA processing 9, U3 small nucleolar RNA binding protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RRP9, Length 1,578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9-201ENST00000232888 KCNJ1P48048 391 aa24.8■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 SNX1Q13596 522 aa24.8■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 PPP1R7Q15435 360 aa24.8■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 DPYSL2Q16555 572 aa24.8■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 CEP57Q86XR8 500 aa24.8■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 CCHCR1Q8TD31 782 aa24.8■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 ATG4AQ8WYN0 398 aa24.8■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 ZNF670Q9BS34 389 aa24.8■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 TTPALQ9BTX7 342 aa24.8■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 CALN1Q9BXU9 219 aa24.8■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 YJEFN3A6XGL0 299 aa24.8■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 E7ENQ6 273 aa24.8■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 TBC1D4O60343 1298 aa24.8■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 CST8O60676 142 aa24.8■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 UPP2O95045 317 aa24.8■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 EFEMP2O95967 443 aa24.8■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 F9P00740 461 aa24.8■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 ADCY2Q08462 1091 aa24.8■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 PTK6Q13882 451 aa24.8■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 DPYSL3Q14195 570 aa24.8■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 RAB6CQ53S08 254 aa24.8■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP24.8■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 RFX6Q8HWS3 928 aa24.8■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 RAB6CQ9H0N0 254 aa24.8■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 CWH43Q9H720 699 aa24.8■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 FAM53CQ9NYF3 392 aa24.8■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 FYNP06241 537 aa24.79■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 CYP2F1P24903 491 aa24.79■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 BHLHA9Q7RTU4 235 aa24.79■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 MREGQ8N565 214 aa24.79■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 FAF2Q96CS3 445 aa24.79■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 RNF157Q96PX1 679 aa24.79■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 PCDH18Q9HCL0 1135 aa24.79■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa24.78■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 TNFRSF10BO14763 440 aa24.78■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 SASH3O75995 380 aa24.78■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 APOC2P02655 101 aa24.78■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 ITGAVP06756 1048 aa24.78■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 CD48P09326 243 aa24.78■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 ECHS1P30084 290 aa24.78■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 VCPP55072 806 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 KRT17Q04695 432 aa24.78■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 GPR17Q13304 367 aa24.78■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 TRADDQ15628 312 aa24.78■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 HFE2Q6ZVN8 426 aa24.78■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 SLC35B2Q8TB61 432 aa24.78■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 SPPL2BQ8TCT7 592 aa24.78■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 DPH5Q9H2P9 285 aa24.78■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 LTBP2Q14767 1821 aa24.78■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 NLRC5Q86WI3 1866 aa24.78■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 PTPRDP23468 1912 aa24.78■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 M0QYT0 321 aa24.77■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 OR4Q2P0C623 313 aa24.77■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 CSF2RAP15509 400 aa24.77■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 DEUP1Q05D60 604 aa24.77■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 SYPL2Q5VXT5 272 aa24.77■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 ZNF365Q70YC5 407 aa24.77■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP24.77■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 CCDC89Q8N998 374 aa24.77■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 CCDC114Q96M63 670 aa24.77■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 ADAM33Q9BZ11 813 aa24.77■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 OGFRQ9NZT2 677 aa24.77■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 WHRNQ9P202 907 aa24.77■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 HCSTQ9UBK5 93 aa24.77■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 AP4E1Q9UPM8 1137 aa24.77■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa24.77■■□□□ 1.56
RRP9-201ENST00000232888 NCAM1P13591 858 aa24.76■■□□□ 1.55
RRP9-201ENST00000232888 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
RRP9-201ENST00000232888 L1CAMP32004 1257 aa24.76■■□□□ 1.55
RRP9-201ENST00000232888 SLC5A3P53794 718 aa24.76■■□□□ 1.55
RRP9-201ENST00000232888 GPS2Q13227 327 aa24.76■■□□□ 1.55
RRP9-201ENST00000232888 OASLQ15646 514 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
RRP9-201ENST00000232888 USP41Q3LFD5 358 aa24.76■■□□□ 1.55
RRP9-201ENST00000232888 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
RRP9-201ENST00000232888 BBOF1Q8ND07 529 aa24.76■■□□□ 1.55
RRP9-201ENST00000232888 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
RRP9-201ENST00000232888 NTAN1Q96AB6 310 aa24.76■■□□□ 1.55
RRP9-201ENST00000232888 LRRC45Q96CN5 670 aa24.76■■□□□ 1.55
RRP9-201ENST00000232888 IGSF21Q96ID5 467 aa24.76■■□□□ 1.55
RRP9-201ENST00000232888 TRIM31Q9BZY9 425 aa24.76■■□□□ 1.55
RRP9-201ENST00000232888 FBXO44Q9H4M3 255 aa24.76■■□□□ 1.55
RRP9-201ENST00000232888 FZD10Q9ULW2 581 aa24.76■■□□□ 1.55
RRP9-201ENST00000232888 SNX24Q9Y343 169 aa24.76■■□□□ 1.55
RRP9-201ENST00000232888 NEU2Q9Y3R4 380 aa24.76■■□□□ 1.55
RRP9-201ENST00000232888 BACE2Q9Y5Z0 518 aa24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms