RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219473.11

USP10-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP10, Length 3,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-201ENST00000219473 CYB5D1Q6P9G0 228 aa15.53■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 TTC39CQ8N584 583 aa15.53■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 FITM2Q8N6M3 262 aa15.53■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 LRRC8CQ8TDW0 803 aa15.53■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa15.53■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 ACSS3Q9H6R3 686 aa15.53■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 USP29Q9HBJ7 922 aa15.53■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa15.53■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 SLC24A2Q9UI40 661 aa15.53■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 PHTF1Q9UMS5 762 aa15.53■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa15.52■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 RASSF9O75901 435 aa15.52■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 FAM155BO75949 473 aa15.52■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 STAU1O95793 577 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 DESP17661 470 aa15.52■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 ZFP42Q96MM3 310 aa15.52■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 CD248Q9HCU0 757 aa15.52■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
USP10-201ENST00000219473 NDC80O14777 642 aa15.52■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 MGAT5Q09328 741 aa15.52■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 MTFR1Q15390 333 aa15.52■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 CCDC185Q8N715 623 aa15.52■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 SLC17A7Q9P2U7 560 aa15.52■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 TRIM33Q9UPN9 1127 aa15.52■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 F2P00734 622 aa15.52■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 GHRP10912 638 aa15.52■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 PDK2Q15119 407 aa15.52■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 SPRYD7Q5W111 196 aa15.52■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP15.52■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 ARRDC4Q8NCT1 418 aa15.52■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 APPL2Q8NEU8 664 aa15.52■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 TCP10LQ8TDR4 215 aa15.52■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 DENND1AQ8TEH3 1009 aa15.52■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 ECT2Q9H8V3 914 aa15.52■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 AP4E1Q9UPM8 1137 aa15.52■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa15.52■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 TKTP29401 623 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 BST2Q10589 180 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 PTK7Q13308 1070 aa15.51■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 KLHL38Q2WGJ6 581 aa15.51■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 LRRC52Q8N7C0 313 aa15.51■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 PPM1NQ8N819 430 aa15.51■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 CEP41Q9BYV8 373 aa15.51■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa15.51■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 ETNK1Q9HBU6 452 aa15.51■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 SLC12A4Q9UP95 1085 aa15.51■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 MEIS3P2A8K0S8 358 aa15.51■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 E7ESA3 106 aa15.51■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 INHBAP08476 426 aa15.51■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 RARBP10826 455 aa15.51■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 AMPD1P23109 780 aa15.51■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 KCNJ11Q14654 390 aa15.51■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 ECHDC2Q86YB7 292 aa15.51■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 C2orf69Q8N8R5 385 aa15.51■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 DCAKDQ8WVC6 231 aa15.51■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 CYTH2Q99418 400 aa15.51■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 TBCBQ99426 244 aa15.51■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 ETNK2Q9NVF9 386 aa15.51■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 CNTN3Q9P232 1028 aa15.51■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa15.5■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP15.5■□□□□ 0.078e-11■■□□□ 14.2
USP10-201ENST00000219473 TYROBPO43914 113 aa15.5■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 HUS1O60921 280 aa15.5■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 NEFHP12036 1026 aa15.5■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 BCAT1P54687 386 aa15.5■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 KCNJ2P63252 427 aa15.5■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 ADIGQ0VDE8 80 aa15.5■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 FAAP100Q0VG06 881 aa15.5■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 OVGP1Q12889 678 aa15.5■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 DCAF6Q58WW2 860 aa15.5■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 ADGRD1Q6QNK2 874 aa15.5■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 ADGRF2Q8IZF7 708 aa15.5■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 ANKRD52Q8NB46 1076 aa15.5■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 SENP1Q9P0U3 644 aa15.5■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 PAK5Q9P286 719 aa15.5■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa15.5■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 MT-ND3P03897 115 aa15.5■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 GOT1P17174 413 aa15.5■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 L1CAMP32004 1257 aa15.5■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 PSEN2P49810 448 aa15.5■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 ALKAL1Q6UXT8 129 aa15.5■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa15.5■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 STK38LQ9Y2H1 464 aa15.5■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 IPPQ9Y573 584 aa15.5■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 GRIA1P42261 906 aa15.49■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 NDUFV1P49821 464 aa15.49■□□□□ 0.07
USP10-201ENST00000219473 TAF6P49848 677 aa15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.1 ms