RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000054666.10

VAMP3-201, Transcript of vesicle associated membrane protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP3, Length 2,205 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3-201ENST00000054666 IFNL1Q8IU54 200 aa8.6□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa8.6□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 CLEC4CQ8WTT0 213 aa8.6□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 CKAP2Q8WWK9 683 aa8.6□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 MAML1Q92585 1016 aa8.6□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 MAGEB18Q96M61 343 aa8.6□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 MED10Q9BTT4 135 aa8.6□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 RAB6CQ9H0N0 254 aa8.6□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 TRABDQ9H4I3 376 aa8.6□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa8.6□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 LRRC4Q9HBW1 653 aa8.6□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 MLXIPLQ9NP71 852 aa8.6□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 RAB6BQ9NRW1 208 aa8.6□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 GJD2Q9UKL4 321 aa8.6□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 CHMP2BQ9UQN3 213 aa8.6□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 CDY2AQ9Y6F7 541 aa8.6□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 IKBKGQ9Y6K9 419 aa8.6□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 CAPN7Q9Y6W3 813 aa8.6□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 CLUHO75153 1309 aa8.59□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 TCP11X1B4DZS4 312 aa8.59□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 CYB561D2O14569 222 aa8.59□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 DAB1O75553 588 aa8.59□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 FSBPO95073 299 aa8.59□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 NPR3P17342 541 aa8.59□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 SSTR1P30872 391 aa8.59□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 RPL34P49207 117 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 SULT1E1P49888 294 aa8.59□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 INHBEP58166 350 aa8.59□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 ADIGQ0VDE8 80 aa8.59□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 SREBF2Q12772 1141 aa8.59□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 CA9Q16790 459 aa8.59□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 CCDC142Q17RM4 750 aa8.59□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 GNASQ5JWF2 1037 aa8.59□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF618Q5T7W0 954 aa8.59□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 RGMBQ6NW40 437 aa8.59□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa8.59□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 PQLC3Q8N755 202 aa8.59□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 PCDH19Q8TAB3 1148 aa8.59□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 RTP4Q96DX8 246 aa8.59□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 LPIN3Q9BQK8 851 aa8.59□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 PLCD4Q9BRC7 762 aa8.59□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 ACSS3Q9H6R3 686 aa8.59□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 STAP1Q9ULZ2 295 aa8.59□□□□□ -1.03
VAMP3-201ENST00000054666 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 SUN1O94901 812 aa8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 CPP00450 1065 aa8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 CTSHP09668 335 aa8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 FAM163BP0C2L3 166 aa8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 FAM200BP0CF97 657 aa8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 GCAP28676 217 aa8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 RBL1P28749 1068 aa8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 TKTP29401 623 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 MATKP42679 507 aa8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 MSH2P43246 934 aa8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 NR2C2P49116 596 aa8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 GPX6P59796 221 aa8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 GAD2Q05329 585 aa8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 XRCC4Q13426 336 aa8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 SPARCL1Q14515 664 aa8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 KCNJ11Q14654 390 aa8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 MFSD14CQ5VZR4 134 aa8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 LIMS2Q7Z4I7 341 aa8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 PIGWQ7Z7B1 504 aa8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 PIGZQ86VD9 579 aa8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 VPS52Q8N1B4 723 aa8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 ARRDC4Q8NCT1 418 aa8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 FBF1Q8TES7 1133 aa8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP8.58□□□□□ -1.048e-7■□□□□ 9
VAMP3-201ENST00000054666 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 CYTH2Q99418 400 aa8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 PAFAH2Q99487 392 aa8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 FERMT1Q9BQL6 677 aa8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 DUSP16Q9BY84 665 aa8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 FAM105AQ9NUU6 356 aa8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 RABGEF1Q9UJ41 708 aa8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 FOXO6A8MYZ6 492 aa8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 PTGESO14684 152 aa8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 SNX3O60493 162 aa8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 SPAG7O75391 227 aa8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 RARBP10826 455 aa8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 CA4P22748 312 aa8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 IL4RP24394 825 aa8.58□□□□□ -1.04
VAMP3-201ENST00000054666 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
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