RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029180.13

Rprd1b-201, Transcript of Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rprd1b, Length 4,283 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Znf280dQ68FE8 974 aa9.28□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Q80ZQ3 298 aa9.28□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Uba6Q8C7R4 1053 aa9.28□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sgpl1Q8R0X7 568 aa9.28□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dqx1Q924H9 718 aa9.28□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Bbox1Q924Y0 387 aa9.28□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ier5lQ99J55 406 aa9.28□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ifrd2Q9D8U0 441 aa9.28□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm43951A0A0N4SUT6 962 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Lrrc38A2VDH3 298 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Iqca1lA6H690 825 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 TazI7HJS2 263 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pgrmc1O55022 195 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Prim2P33610 505 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sar1aP36536 198 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 SpoplQ2M2N2 392 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 StimateQ3UF25 288 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Capn13Q3UW68 665 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Spa17Q62252 149 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rad9bQ6WBX7 403 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mettl21cQ8BLU2 248 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Prr33Q8C494 260 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Vps37bQ8R0J7 285 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 VillQ91YD6 859 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sytl1Q99N80 567 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 RnmtQ9D0L8 465 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trim54Q9ERP3 366 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gadd45gQ9Z111 159 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 F8Q06194 2319 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zscan4-ps1A0A1C7CYV3 506 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm12248A0A1W2P8B8 313 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 AunipE9Q6Z5 340 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kcnk16G5E845 292 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 LynP25911 512 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pcyt1aP49586 367 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 SbdsP70122 250 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Taf1bP97358 586 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pdlim7Q3TJD7 457 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tmem35bQ3U0Y2 150 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 GcgrQ61606 485 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Hsph1Q61699 858 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rab34Q64008 259 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 SnphQ80U23 495 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Znf879Q8BI99 563 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Usp1Q8BJQ2 784 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tmem220Q8BP07 167 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Arhgap24Q8C4V1 747 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Uba3Q8C878 462 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Plekhn1Q8C886 359 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ildr1Q8CBR1 537 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mrpl58Q8R035 206 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cyp2c50Q91X77 490 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pcdhgb4Q91XX6 912 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Med15Q924H2 789 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ctu1Q99J10 420 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PpidQ9CR16 370 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Krt7Q9DCV7 457 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Anapc7Q9WVM3 565 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 5830473C10RikF8VQ07 620 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ebf3O08791 596 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nptx2O70340 429 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pon1P52430 355 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Adcy8P97490 1249 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm14685Q52KH6 695 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kcna4Q61423 654 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ints8Q80V86 995 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Setdb2Q8C267 713 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Appl1Q8K3H0 707 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 IntS13Q8QZV7 732 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 AagabQ8R2R3 316 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tmprss4Q8VCA5 435 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Emc2Q9CRD2 297 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Chek2Q9Z265 546 aa9.27□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm3127E9Q9P5 263 aa9.26□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm3453K7N724 263 aa9.26□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Aldh2P47738 519 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 SqleP52019 572 aa9.26□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fitm2P59266 262 aa9.26□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PhbP67778 272 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mgat3Q10470 538 aa9.26□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Smarcal1Q8BJL0 910 aa9.26□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Znf451Q8C0P7 1056 aa9.26□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 ScaiQ8C8N2 606 aa9.26□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nup85Q8R480 656 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Def8Q99J78 448 aa9.26□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Q9D1F3 157 aa9.26□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gpc6Q9R087 555 aa9.26□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Col11a1Q61245 1804 aa9.26□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kntc1Q8C3Y4 2207 aa9.26□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm28043E0CXC2 719 aa9.26□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tlk2O55047 718 aa9.26□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 CraddO88843 199 aa9.26□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tmem63bQ3TWI9 832 aa9.26□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 KhsrpQ3U0V1 748 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 FaxcQ3UMF9 409 aa9.26□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 E330034G19RikQ3UWX6 351 aa9.26□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ptpn14Q62130 1189 aa9.26□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nsun6Q7TS68 476 aa9.26□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dennd2aQ8C4S8 1000 aa9.26□□□□□ -0.93
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Btbd9Q8C726 612 aa9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 52 ms