RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025262.5

Ltb-201, Transcript of Lymphotoxin-beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ltb, Length 1,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rassf9Q8K342 435 aa20.04■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr1499Q8VG65 314 aa20.04■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fam49bQ921M7 324 aa20.04■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Haus2Q9CQS9 234 aa20.04■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Eef1akmt2Q9D853 244 aa20.04■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pkd2l2Q9JLG4 621 aa20.04■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Igkv5-43A0A0B4J1J2 115 aa20.03■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm5160F8VPN3 147 aa20.03■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Bub1O08901 1058 aa20.03■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Abcb1bP06795 1276 aa20.03■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc11a1P41251 548 aa20.03■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Plk2P53351 682 aa20.03■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fam149aQ8CFV2 787 aa20.03■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Txndc11Q8K2W3 948 aa20.03■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zc3h10Q8R205 435 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Synpo2Q91YE8 1087 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Acot9Q9R0X4 439 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tmem196V9GX04 182 aa20.03■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm10720D3Z1I5 223 aa20.02■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Vmn2r79E9Q067 851 aa20.02■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Vmn2r15L7N2A0 855 aa20.02■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tpd52l1O54818 204 aa20.02■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 LcatP16301 438 aa20.02■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mrps6P58064 125 aa20.02■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fam171bQ14CH0 825 aa20.02■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ccdc66Q6NS45 935 aa20.02■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ankzf1Q80UU1 748 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slco2b1Q8BXB6 683 aa20.02■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Srek1Q8BZX4 494 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ldlrap1Q8C142 308 aa20.02■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Vcpip1Q8CDG3 1220 aa20.02■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Vmn1r188Q8K3N2 308 aa20.02■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tasp1Q8R1G1 420 aa20.02■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ap3m2Q8R2R9 418 aa20.02■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Stk38Q91VJ4 465 aa20.02■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Creld1Q91XD7 420 aa20.02■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cmtm8Q9CZR4 173 aa20.02■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Chordc1Q9D1P4 331 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Atg2bQ80XK6 2075 aa20.01■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pgbd5D3YZI9 523 aa20.01■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sptbn5F6UCX4 1208 aa20.01■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Vmn1r176G3UW31 304 aa20.01■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 CkmP07310 381 aa20.01■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tsta3P23591 321 aa20.01■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Atp6v1dP57746 247 aa20.01■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr855Q7TRF8 312 aa20.01■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr698Q7TRN4 311 aa20.01■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Erlin2Q8BFZ9 340 aa20.01■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tmem30bQ8BHG3 353 aa20.01■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Znf628Q8CJ78 1038 aa20.01■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pop1Q8K205 1045 aa20.01■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tram1l1Q8QZR0 363 aa20.01■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ces2aQ8QZR3 558 aa20.01■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Barhl2Q8VIB5 384 aa20.01■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ppp1r3aQ99MR9 1089 aa20.01■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 AdarQ99MU3 1178 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Grtp1Q9D3N8 359 aa20.01■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fam43bA2AM80 330 aa20■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gimap9G3X987 291 aa20■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Edil3O35474 480 aa20■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 P01650 108 aa20■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 P01653 108 aa20■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 MyogP12979 224 aa20■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gtf3c3Q3TMP1 882 aa20■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Agap2Q3UHD9 1186 aa20■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sun3Q5SS91 320 aa20■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fam46cQ5SSF7 391 aa20■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 DazlQ64368 298 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mettl20Q80ZM3 255 aa20■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Aste1Q8BIR2 672 aa20■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cadm4Q8R464 388 aa20■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 NamptQ99KQ4 491 aa20■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tlr9Q9EQU3 1032 aa20■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Coro1bQ9WUM3 484 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 NbeaQ9EPN1 2936 aa19.99■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 OtofQ9ESF1 1997 aa19.99■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 NcapgE9PWG6 1004 aa19.99■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm7714E9Q079 131 aa19.99■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Top6blJ3QMY9 579 aa19.99■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Timp1P12032 205 aa19.99■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ighmbp2P40694 993 aa19.99■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zfp217Q3U0X6 1041 aa19.99■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Garem1Q3UFT3 876 aa19.99■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cpa2Q504N0 417 aa19.99■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dhrs13Q5SS80 376 aa19.99■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 PterQ60866 349 aa19.99■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dlg4Q62108 724 aa19.99■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Znf512Q69Z99 562 aa19.99■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cep135Q6P5D4 1140 aa19.99■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rnf139Q7TMV1 668 aa19.99■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 RtbdnQ8QZY4 247 aa19.99■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zdhhc3Q8R173 299 aa19.99■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ppa2Q91VM9 330 aa19.99■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rnf138rt1Q9D9M9 248 aa19.99■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cts8Q9JI81 333 aa19.99■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tex21Q9R0U9 575 aa19.99■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 AtrxQ61687 2476 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sp3O70494 783 aa19.98■□□□□ 0.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Atg9bQ6EBV9 922 aa19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26 ms