RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639848.1

HLA-B-256, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, human

BASIC

Gene HLA-B, Length 1,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HLA-B-256	ENST00000639848	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		21.28	■■□□□ 1
HLA-B-256	ENST00000639848	NACA2	Q9H009	215 aa		21.28	■■□□□ 1
HLA-B-256	ENST00000639848	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		21.28	■■□□□ 1
HLA-B-256	ENST00000639848	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		21.28	■■□□□ 1
HLA-B-256	ENST00000639848	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		21.28	■■□□□ 1
HLA-B-256	ENST00000639848	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		21.28	■■□□□ 1
HLA-B-256	ENST00000639848	PATJ	Q8NI35	1801 aa		21.27	■■□□□ 1
HLA-B-256	ENST00000639848	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	21.27	■■□□□ 1
HLA-B-256	ENST00000639848	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	21.27	■■□□□ 1
HLA-B-256	ENST00000639848	PLA2G4A	P47712	749 aa		21.27	■■□□□ 1
HLA-B-256	ENST00000639848	PGF	P49763	221 aa		21.27	■■□□□ 1
HLA-B-256	ENST00000639848	MFAP3	P55082	362 aa		21.27	■■□□□ 1
HLA-B-256	ENST00000639848	PKDCC	Q504Y2	493 aa		21.27	■■□□□ 1
HLA-B-256	ENST00000639848	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		21.27	■■□□□ 1
HLA-B-256	ENST00000639848	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		21.27	■■□□□ 1
HLA-B-256	ENST00000639848	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		21.27	■■□□□ 1
HLA-B-256	ENST00000639848	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		21.27	■■□□□ 1
HLA-B-256	ENST00000639848	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		21.27	■■□□□ 1
HLA-B-256	ENST00000639848	OTUB2	Q96DC9	234 aa		21.27	■■□□□ 1
HLA-B-256	ENST00000639848	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	21.27	■■□□□ 1
HLA-B-256	ENST00000639848	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		21.27	■■□□□ 1
HLA-B-256	ENST00000639848	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		21.27	■■□□□ 1
HLA-B-256	ENST00000639848	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	21.27	■■□□□ 1
HLA-B-256	ENST00000639848	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	21.27	■■□□□ 1
HLA-B-256	ENST00000639848	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	21.27	■■□□□ 1
HLA-B-256	ENST00000639848	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		21.27	■■□□□ 1
HLA-B-256	ENST00000639848	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		21.27	■■□□□ 1
HLA-B-256	ENST00000639848	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	21.27	■■□□□ 1
HLA-B-256	ENST00000639848		A0A1W2PQH9	124 aa		21.26	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	21.26	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	21.26	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	LAMTOR5	O43504	91 aa		21.26	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	21.26	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	GJA4	P35212	333 aa		21.26	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	PON2	Q15165	354 aa		21.26	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		21.26	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		21.26	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	TFAP2B	Q92481	460 aa		21.26	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	CHFR	Q96EP1	664 aa		21.26	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		21.26	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	NDST4	Q9H3R1	872 aa		21.26	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	NMUR1	Q9HB89	426 aa		21.26	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	ANO10	Q9NW15	660 aa		21.26	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	OSER1	Q9NX31	292 aa		21.26	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	NAGPA	Q9UK23	515 aa		21.26	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		21.26	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	21.26	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	RALA	P11233	206 aa		21.25	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	RARG	P13631	454 aa		21.25	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	SLC9A1	P19634	815 aa		21.25	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	PON1	P27169	355 aa		21.25	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	TKTL1	P51854	596 aa		21.25	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	CCIN	Q13939	588 aa		21.25	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	MEA1	Q16626	185 aa		21.25	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		21.25	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	VWA3B	Q502W6	1294 aa		21.25	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		21.25	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	SCD5	Q86SK9	330 aa		21.25	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		21.25	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	SCML4	Q8N228	414 aa		21.25	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		21.25	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		21.25	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	F5	P12259	2224 aa		21.24	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	KCNJ18	B7U540	433 aa		21.24	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	ZBED1	O96006	694 aa		21.24	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	KRT5	P13647	590 aa		21.24	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	NBL1	P41271	181 aa		21.24	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		21.24	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		21.24	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	21.24	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	MTAP	Q13126	283 aa		21.24	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	KCNJ12	Q14500	433 aa		21.24	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	STX1A	Q16623	288 aa		21.24	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	MIIP	Q5JXC2	388 aa		21.24	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	21.24	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		21.24	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		21.24	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	21.24	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	21.24	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		21.24	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	21.23	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	PROB1	E7EW31	1015 aa		21.23	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	TULP2	O00295	520 aa		21.23	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	TBX18	O95935	607 aa		21.23	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	DRD1	P21728	446 aa		21.23	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	21.23	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		21.23	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		21.23	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		21.23	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	UBA3	Q8TBC4	463 aa		21.23	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		21.23	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		21.23	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	21.23	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		21.23	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		21.23	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848		M0QYV0	167 aa		21.22	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	MED7	O43513	233 aa		21.22	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	CYP17A1	P05093	508 aa		21.22	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	SP9	P0CG40	484 aa		21.22	■□□□□ 0.99
HLA-B-256	ENST00000639848	CCR3	P51677	355 aa		21.22	■□□□□ 0.99

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