RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638107.1

5S_rRNA.28-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 119 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TMEM25Q86YD3 366 aa6.26□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CRYBG2Q8N1P7 616 aa6.26□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PHTF2Q8N3S3 785 aa6.26□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FRMD1Q8N878 549 aa6.26□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KIAA1958Q8N8K9 716 aa6.26□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CCDC26Q8TAB7 109 aa6.26□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TMC2Q8TDI7 906 aa6.26□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TMEM174Q8WUU8 243 aa6.26□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RLN3Q8WXF3 142 aa6.26□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 JAKMIP2Q96AA8 810 aa6.26□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CYFIP2Q96F07 1278 aa6.26□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TWNKQ96RR1 684 aa6.26□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 EDEM2Q9BV94 578 aa6.26□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MMRN2Q9H8L6 949 aa6.26□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.26□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SPHK2Q9NRA0 654 aa6.26□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FAM49BQ9NUQ9 324 aa6.26□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 COMMD8Q9NX08 183 aa6.26□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TBC1D14Q9P2M4 693 aa6.26□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa6.26□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa6.26□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZDHHC9Q9Y397 364 aa6.26□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa6.26□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NUP205Q92621 2012 aa6.26□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 F5P12259 2224 aa6.26□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 THADAQ6YHU6 1953 aa6.26□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CEP192Q8TEP8 1941 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 A0A0A0MRY4 1105 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LNP1A1A4G5 178 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 C4orf47A7E2U8 309 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HHLA1C9JL84 531 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MDM4O15151 490 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CALUO43852 315 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TULP3O75386 442 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KRT37O76014 449 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ALDH1A2O94788 518 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RHOBTB3O94955 611 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KCNK5O95279 499 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TBX18O95935 607 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ASS1P00966 412 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TRIM49P0CI25 452 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TRIM49CP0CI26 452 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 P4HA1P13674 534 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CD58P19256 250 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NR2F2P24468 414 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ADORA2BP29275 332 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 WASP42768 502 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SYKP43405 635 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GCLMP48507 274 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TUBP50607 506 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 VAMP7P51809 220 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PPP3CAQ08209 521 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NFIL3Q16649 462 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ANO4Q32M45 955 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 EOGTQ5NDL2 527 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 BTBD8Q5XKL5 378 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RNF43Q68DV7 783 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CLEC20AQ6ZU45 233 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 UNC93AQ86WB7 457 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MIB1Q86YT6 1006 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TERB1Q8NA31 727 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 OLIG1Q8TAK6 271 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 WHAMMQ8TF30 809 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TAF4BQ92750 862 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 OTUB2Q96DC9 234 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SPATA32Q96LK8 384 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NACA2Q9H009 215 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NMUR1Q9HB89 426 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 OSER1Q9NX31 292 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 USP25Q9UHP3 1055 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NUDT5Q9UKK9 219 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HCN2Q9UL51 889 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SPAG17Q6Q759 2223 aa6.24□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa6.24□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa6.24□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TBC1D3BA6NDS4 549 aa6.24□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa6.24□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 IKBKBO14920 756 aa6.24□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MAPK13O15264 365 aa6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms