RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 RHOBTB1O94844 696 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CRTAMO95727 393 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ACO1P21399 889 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 AKT1P31749 480 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 TKTL1P51854 596 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 MTFR1Q15390 333 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CHI3L2Q15782 390 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 IL17AQ16552 155 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 AMHR2Q16671 573 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 NT5DC3Q86UY8 548 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC6Q86X45 466 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 MTMR14Q8NCE2 650 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SLC26A7Q8TE54 656 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 DNAJC19Q96DA6 116 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 OSMRQ99650 979 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SIKE1Q9BRV8 207 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ELOVL4Q9GZR5 314 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 LACRTQ9GZZ8 138 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 PHF20L1A8MW92 1017 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 RAD23BP54727 409 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SLC6A3Q01959 620 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 MIIPQ5JXC2 388 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SPANXN3Q5MJ09 141 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SYCP2LQ5T4T6 812 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SPATA16Q9BXB7 569 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CASS4Q9NQ75 786 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 TRIM49D1C9J1S8 452 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 URODP06132 367 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CCND1P24385 295 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 KCNA1Q09470 495 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 GRIK5Q16478 980 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SDE2Q6IQ49 451 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SLC26A11Q86WA9 606 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ING2Q9H160 280 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ANKRD63C9JTQ0 380 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CCR1P32246 355 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 NPY2RP49146 381 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ENPEPQ07075 957 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 TWF1Q12792 350 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 GRTP1Q5TC63 336 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 HIPK4Q8NE63 616 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 DNAJB3Q8WWF6 145 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC4BQ9NT99 713 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 L1RE1Q9UN81 338 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 DERAQ9Y315 318 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SYCE1LA8MT33 242 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.343e-7■■■■□ 19.9
PDE4D-228ENST00000636120 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 KRT72Q14CN4 511 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC38Q5VT99 294 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 KCNK18Q7Z418 384 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 FAM9CQ8IZT9 166 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SERPINB11Q96P15 392 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 RRAGCQ9HB90 399 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 H0Y3Z8 333 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SYF2O95926 243 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ALDH2P05091 517 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SOX10P56693 466 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 FUT2Q10981 343 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ORC1Q13415 861 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM132BQ14DG7 1078 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC55Q6ZSA7 311 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SNX31Q8N9S9 440 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ADGRE3Q9BY15 652 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 GANQ9H2C0 597 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CYP4F11Q9HBI6 524 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 PGAM1P18669 254 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
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