RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 NCAPGQ9BPX3 1015 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 CLSTN3Q9BQT9 956 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB6CQ9H0N0 254 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 CRISPLD1Q9H336 500 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 STK39Q9UEW8 545 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 USP18Q9UMW8 372 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 C2CD2LO14523 706 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 FGF18O76093 207 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 FYNP06241 537 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 KRT7P08729 469 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 OR1D2P34982 312 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 DDR2Q16832 855 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 LONRF2Q1L5Z9 754 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 TEX35Q5T0J7 233 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 VPS52Q8N1B4 723 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAM33Q9BZ11 813 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 TLL1O43897 1013 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 LTFP02788 710 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR15P49685 360 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 KRT17Q04695 432 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC25A52Q3SY17 297 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 STRADAQ7RTN6 431 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR65Q8IYL9 337 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 RCOR2Q8IZ40 523 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 NUP93Q8N1F7 819 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 MMGT1Q8N4V1 131 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 PCSK1NQ9UHG2 260 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 URODP06132 367 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 HDAC4P56524 1084 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 DCAF6Q58WW2 860 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 BNIPLQ7Z465 357 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 PEBP4Q96S96 227 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 TBCBQ99426 244 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 NPY6RQ99463 290 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 ZWILCHQ9H900 591 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 LCHNA4D1U4 455 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 ENDOD1O94919 500 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 KRT1P04264 644 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 DUSP4Q13115 394 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 SDHAF4Q5VUM1 108 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 SYPL2Q5VXT5 272 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 SPATA17Q96L03 361 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 AP1M1Q9BXS5 423 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 KLHL11Q9NVR0 708 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 IL37Q9NZH6 218 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 STAP1Q9ULZ2 295 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 KRIT1O00522 736 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 FSCN2O14926 492 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 PRPSAP2O60256 369 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 ABLIM3O94929 683 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 RARAP10276 462 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 SULT1E1P49888 294 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 SMTNL2Q2TAL5 461 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 MGAT5BQ3V5L5 792 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNT1Q5JUK3 1230 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 BEND5Q7L4P6 421 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 KLHL23Q8NBE8 558 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF461Q8TAF7 563 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 TSC1Q92574 1164 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 SLITRK1Q96PX8 696 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC188H7C350 402 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 CAPN9O14815 690 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 LILRB3O75022 631 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 COPS2P61201 443 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 BSPRYQ5W0U4 402 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 TPGS2Q68CL5 300 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC50Q8IVM0 306 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 RAPGEF5Q92565 580 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 ZBP1Q9H171 429 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXO44Q9H4M3 255 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 HSFX1Q9UBD0 423 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 NR2E1Q9Y466 385 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 PLXNA3P51805 1871 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 PI4K2BG5E9Z4 385 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 SOAT2O75908 522 aa25.98■■□□□ 1.75
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