RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 SLC9A1P19634 815 aa26.22■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 PDE4CQ08493 712 aa26.22■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 STILQ15468 1287 aa26.22■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 MIIPQ5JXC2 388 aa26.22■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 SMYD5Q6GMV2 418 aa26.22■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 TTC16Q8NEE8 873 aa26.22■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 NMUR1Q9HB89 426 aa26.22■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 ANO10Q9NW15 660 aa26.22■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 SMPD4Q9NXE4 827 aa26.22■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa26.22■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 ATG2BQ96BY7 2078 aa26.21■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 H0Y858 1186 aa26.21■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 SETSIPP0DME0 302 aa26.21■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 MFAP3P55082 362 aa26.21■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 AMPD2Q01433 879 aa26.21■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 ANGPT1Q15389 498 aa26.21■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 CNGA2Q16280 664 aa26.21■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 KLHDC10Q6PID8 442 aa26.21■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 C1orf210Q8IVY1 113 aa26.21■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 CPA6Q8N4T0 437 aa26.21■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 NDST4Q9H3R1 872 aa26.21■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 ECT2Q9H8V3 914 aa26.21■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 OSER1Q9NX31 292 aa26.21■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 APEX2Q9UBZ4 518 aa26.21■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP26.21■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 DMDP11532 3685 aa26.2■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 KCNJ18B7U540 433 aa26.2■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 PON1P27169 355 aa26.2■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 PLA2G4AP47712 749 aa26.2■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 KCNJ12Q14500 433 aa26.2■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 STX1AQ16623 288 aa26.2■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 VWA3BQ502W6 1294 aa26.2■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa26.2■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 CHFRQ96EP1 664 aa26.2■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 ZSWIM1Q9BR11 485 aa26.2■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 IER2Q9BTL4 223 aa26.2■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 LINC00597Q9H2U6 94 aa26.2■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP26.2■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 CLIC5Q9NZA1 410 aa26.2■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 CFAP97Q9P2B7 532 aa26.2■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 A0A1W2PQH9 124 aa26.19■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 E2F8A0AVK6 867 aa26.19■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 TULP2O00295 520 aa26.19■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 CHRNB1P11230 501 aa26.19■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 TCP11X2Q5H9J9 407 aa26.19■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 SCD5Q86SK9 330 aa26.19■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 NACA2Q9H009 215 aa26.19■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 CHRDQ9H2X0 955 aa26.19■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 LMAN1LQ9HAT1 526 aa26.19■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 TMEM63CQ9P1W3 806 aa26.19■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 TKTL1P51854 596 aa26.18■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 PM20D1Q6GTS8 502 aa26.18■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 UBA3Q8TBC4 463 aa26.18■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 KCTD13Q8WZ19 329 aa26.18■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 TBC1D14Q9P2M4 693 aa26.18■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 NAGPAQ9UK23 515 aa26.18■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 NFATC1O95644 943 aa26.17■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 RARGP13631 454 aa26.17■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 KRT5P13647 590 aa26.17■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 BRD2P25440 801 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 GJA4P35212 333 aa26.17■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 NR1H3Q13133 447 aa26.17■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 LRRC32Q14392 662 aa26.17■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 PON2Q15165 354 aa26.17■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 DGKKQ5KSL6 1271 aa26.17■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 CDKAL1Q5VV42 579 aa26.17■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 GJB7Q6PEY0 223 aa26.17■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 MAMSTRQ6ZN01 415 aa26.17■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 TADA2BQ86TJ2 420 aa26.17■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 ARHGAP18Q8N392 663 aa26.17■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 SLC35F5Q8WV83 523 aa26.17■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 SIX2Q9NPC8 291 aa26.17■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 TBX18O95935 607 aa26.17■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 ZBED1O96006 694 aa26.17■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 RALAP11233 206 aa26.17■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 SCML4Q8N228 414 aa26.17■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 SHC3Q92529 594 aa26.17■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 LRRC4Q9HBW1 653 aa26.17■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 APBA1Q02410 837 aa26.16■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 CCINQ13939 588 aa26.16■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 MEA1Q16626 185 aa26.16■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 TMEM196Q5HYL7 178 aa26.16■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 USP34Q70CQ2 3546 aa26.16■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa26.16■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 OTUB2Q96DC9 234 aa26.16■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 ULBP1Q9BZM6 244 aa26.16■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 DNMT3LQ9UJW3 386 aa26.16■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa26.16■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 M0QYV0 167 aa26.15■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 CALCAP01258 141 aa26.15■■□□□ 1.78
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