RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 DMAC2Q9NW81 257 aa26.42■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 GMIPQ9P107 970 aa26.42■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa26.42■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 GON4LQ3T8J9 2241 aa26.41■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 ME1P48163 572 aa26.41■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa26.41■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa26.41■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa26.41■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 KRT82Q9NSB4 513 aa26.41■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 GIPC1O14908 333 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 KLRC4O43908 158 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 AP1G2O75843 785 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 CLSTN1O94985 981 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 IRX4P78413 519 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 STK4Q13043 487 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 LPCAT2Q7L5N7 544 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 ACOT1Q86TX2 421 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 SLC9A9Q8IVB4 645 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 BBS7Q8IWZ6 715 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 FRMD1Q8N878 549 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 NAT16Q8N8M0 369 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 ZMIZ2Q8NF64 920 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 KCNV2Q8TDN2 545 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 PIGKQ92643 395 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 WBP2Q969T9 261 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 SPACA7Q96KW9 195 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 SMOQ99835 787 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP26.4■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 TBC1D3BA6NDS4 549 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 TULP3O75386 442 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 MAP7D1Q3KQU3 841 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 BTBD8Q5XKL5 378 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM25Q86YD3 366 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 KIAA0895Q8NCT3 520 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 HMGB4Q8WW32 186 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 SPHK2Q9NRA0 654 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 DEC1Q9P2X7 70 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa26.38■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 MAP3K13O43283 966 aa26.38■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 BEST1O76090 585 aa26.38■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 SLFN14P0C7P3 912 aa26.38■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 P4HA1P13674 534 aa26.38■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC130P13994 396 aa26.38■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 PGFP49763 221 aa26.38■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 DLG4P78352 724 aa26.38■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa26.38■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa26.38■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 TMEFF1Q8IYR6 380 aa26.38■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 CEP57L1Q8IYX8 460 aa26.38■■□□□ 1.81
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PTPRF-216ENST00000617451 SNX21Q969T3 373 aa26.38■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 ASPMQ8IZT6 3477 aa26.38■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa26.37■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 F13A1P00488 732 aa26.37■■□□□ 1.81
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PTPRF-216ENST00000617451 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
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PTPRF-216ENST00000617451 ZACNQ401N2 412 aa26.37■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 SPDYCQ5MJ68 293 aa26.37■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 ATL3Q6DD88 541 aa26.37■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 SLC2A14Q8TDB8 520 aa26.37■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 NACA2Q9H009 215 aa26.37■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 KCTD10Q9H3F6 313 aa26.37■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 FBXO44Q9H4M3 255 aa26.37■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 HMGXB4Q9UGU5 601 aa26.37■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 SERTAD1Q9UHV2 236 aa26.37■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
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PTPRF-216ENST00000617451 IRF1P10914 325 aa26.36■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 NDST1P52848 882 aa26.36■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 ORC1Q13415 861 aa26.36■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 HTR3DQ70Z44 454 aa26.36■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 UNC93AQ86WB7 457 aa26.36■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 SYT12Q8IV01 421 aa26.36■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 PGBD3Q8N328 593 aa26.36■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 TERB1Q8NA31 727 aa26.36■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 TAF4BQ92750 862 aa26.36■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 PAGE5Q96GU1 130 aa26.36■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM74BQ9NUR3 256 aa26.36■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 EXOC1Q9NV70 894 aa26.36■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 HCN2Q9UL51 889 aa26.36■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 GREM1O60565 184 aa26.35■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 CEACAM1P13688 526 aa26.35■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 MAP3K7CLP57077 242 aa26.35■■□□□ 1.81
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