RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611278.4

ZNF248-208, Transcript of zinc finger protein 248, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF248, Length 4,204 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248-208ENST00000611278 USP27XA6NNY8 438 aa8.96□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 CD58P19256 250 aa8.96□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 VIPR2P41587 438 aa8.96□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 GNG11P61952 73 aa8.96□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 ACCSLQ4AC99 568 aa8.96□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 BROXQ5VW32 411 aa8.96□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 NUGGCQ68CJ6 796 aa8.96□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 CEP120Q8N960 986 aa8.96□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 RSAD2Q8WXG1 361 aa8.96□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa8.96□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 ZSCAN12O43309 604 aa8.96□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 TUBB4AP04350 444 aa8.96□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 OR4Q2P0C623 313 aa8.96□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 FDPSP14324 419 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 ACO1P21399 889 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 ETFBP38117 255 aa8.96□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 VAMP7P51809 220 aa8.96□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 STX1AQ16623 288 aa8.96□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 KIAA1958Q8N8K9 716 aa8.96□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 TMC2Q8TDI7 906 aa8.96□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 OMDQ99983 421 aa8.96□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP8.96□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 M0QZQ0 153 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 TACC1O75410 805 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 DGKGP49619 791 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 MFAP3P55082 362 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 KDSRQ06136 332 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 GAB3Q8WWW8 586 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 MED15Q96RN5 788 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 CDC6Q99741 560 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 EBF3Q9H4W6 596 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 CXorf56Q9H5V9 222 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 TELO2Q9Y4R8 837 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 CPQQ9Y646 472 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 EYSQ5T1H1 3165 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 SLC12A8A0AV02 714 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 DFNA5O60443 496 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 SERPINC1P01008 464 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 ASLP04424 464 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 PEX6Q13608 980 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 MPPE1Q53F39 396 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 LILRA6Q6PI73 481 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 B3GNT9Q6UX72 402 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 OXR1Q8N573 874 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 SPAG5Q96R06 1193 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 FUCA2Q9BTY2 467 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 ADAM21Q9UKJ8 722 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 MTMR6Q9Y217 621 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 M0QYT0 321 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 PTGESO14684 152 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 RRP8O43159 456 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 NR3C1P04150 777 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 CDK4P11802 303 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 ZNF132P52740 706 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 SEC13P55735 322 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 PTK2Q05397 1052 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 DUOXA1Q1HG43 343 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 TMEM105Q8N8V8 129 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 OSCP1Q8WVF1 389 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 SLC6A14Q9UN76 642 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 DOCK5Q9H7D0 1870 aa8.95□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 YKT6O15498 198 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 ABLIM3O94929 683 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 SETSIPP0DME0 302 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 GJA1P17302 382 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 GTF2H1P32780 548 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 SULT2A1Q06520 285 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 DDR2Q16832 855 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 BSNDQ8WZ55 320 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 C8orf48Q96LL4 319 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 SEMA4GQ9NTN9 838 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 VCANP13611 3396 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 MEIS3P2A8K0S8 358 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 HOXD12P35452 270 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 CDR1P51861 262 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 BCAT1P54687 386 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms