RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588419.1

HDAC5-208, Transcript of histone deacetylase 5, humanhuman

TSL 2

Gene HDAC5, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5-208ENST00000588419 MMRN2Q9H8L6 949 aa14.53□□□□□ -0.08
HDAC5-208ENST00000588419 TBC1D14Q9P2M4 693 aa14.53□□□□□ -0.08
HDAC5-208ENST00000588419 HMGXB4Q9UGU5 601 aa14.53□□□□□ -0.08
HDAC5-208ENST00000588419 ACACBO00763 2458 aa14.52□□□□□ -0.08
HDAC5-208ENST00000588419 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa14.52□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 TBC1D3BA6NDS4 549 aa14.52□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 VNN1O95497 513 aa14.52□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 P4HA1P13674 534 aa14.52□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 WASP42768 502 aa14.52□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 MAP3K7CLP57077 242 aa14.52□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 GAD2Q05329 585 aa14.52□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 STK4Q13043 487 aa14.52□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 PKP1Q13835 747 aa14.52□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 KMT5BQ4FZB7 885 aa14.52□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 TMEFF1Q8IYR6 380 aa14.52□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 FRMD1Q8N878 549 aa14.52□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 IL17RCQ8NAC3 791 aa14.52□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 SLC2A14Q8TDB8 520 aa14.52□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 PARD3BQ8TEW8 1205 aa14.52□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 OVCA2Q8WZ82 227 aa14.52□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 E2F8A0AVK6 867 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 GIPC1O14908 333 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 KLRC4O43908 158 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 BEST1O76090 585 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 NR3C1P04150 777 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 FAM163BP0C2L3 166 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 PMLP29590 882 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 GRIA2P42262 883 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 NDST1P52848 882 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 AP3M2P53677 418 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 C10orf76Q5T2E6 689 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 PAQR9Q6ZVX9 377 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 LPCAT2Q7L5N7 544 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 FUKQ8N0W3 1084 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 WBP2Q969T9 261 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 SMOQ99835 787 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 TMEM9BQ9NQ34 198 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 A0A1B0GVL5 298 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 TM4SF5O14894 197 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 TLR5O60602 858 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 TULP3O75386 442 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 KIF20AO95235 890 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 MAPK8P45983 427 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 FOXC1Q12948 553 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 TPGS1Q6ZTW0 290 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 DEFB119Q8N690 84 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 C12orf29Q8N999 325 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 ZMIZ2Q8NF64 920 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 BHMTQ93088 406 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 PAGE5Q96GU1 130 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 VRTNQ9H8Y1 702 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 SPHK2Q9NRA0 654 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 DEC1Q9P2X7 70 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 CFAP45Q9UL16 551 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 GON4LQ3T8J9 2241 aa14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 TNFRSF10BO14763 440 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 MDM4O15151 490 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 TRIM24O15164 1050 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 CYP26A1O43174 497 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 ADAM23O75077 832 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 TBX18O95935 607 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 HLA-DRAP01903 254 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 SLFN14P0C7P3 912 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 FAM200BP0CF97 657 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 HOXB2P14652 356 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 PFKFB1P16118 471 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 CD58P19256 250 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 P2RY2P41231 377 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 TNFRSF4P43489 277 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 PGFP49763 221 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 IRX4P78413 519 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 TRIM61Q5EBN2 209 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 GRAMD4Q6IC98 578 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 TMEM25Q86YD3 366 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 TERB1Q8NA31 727 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 SNX21Q969T3 373 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 OTUB2Q96DC9 234 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 IMPG2Q9BZV3 1241 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 FBXO44Q9H4M3 255 aa14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
HDAC5-208ENST00000588419 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.2 ms