RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587914.1

EFTUD2-208, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-208	ENST00000587914		Q9Y3F1	56 aa		7.53	□□□□□ -1.2
EFTUD2-208	ENST00000587914	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		7.53	□□□□□ -1.2
EFTUD2-208	ENST00000587914	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	GJB6	O95452	261 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	F2	P00734	622 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	VTN	P04004	478 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	KRT10	P13645	584 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	SMPD1	P17405	629 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	CYP3A5	P20815	502 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	PHB	P35232	272 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	GJC1	P36383	396 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	RAP1GAP	P47736	663 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	NDST1	P52848	882 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	ARL4C	P56559	192 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	FOXK2	Q01167	660 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	GPS1	Q13098	491 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	KYNU	Q16719	465 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	TMEM110	Q86TL2	294 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	NME8	Q8N427	588 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	KCTD6	Q8NC69	237 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	ARMC5	Q96C12	935 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	SGSM3	Q96HU1	749 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	SNX27	Q96L92	541 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	TWNK	Q96RR1	684 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	EURL	Q9NYK6	297 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	CNTN3	Q9P232	1028 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	USP18	Q9UMW8	372 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	SCN4A	P35499	1836 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914		E7ESA3	106 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	SGK1	O00141	431 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	MCF2L	O15068	1137 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	PRPSAP2	O60256	369 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	CST8	O60676	142 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	GPR32	O75388	356 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	SPAG6	O75602	509 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	GSTA1	P08263	222 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	ZNF286B	P0CG31	522 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	KCNE1	P15382	129 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	TCF4	P15884	667 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	TGM2	P21980	687 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	IL1R2	P27930	398 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	MIP	P30301	263 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	PTPN9	P43378	593 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	ACADSB	P45954	432 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	SLCO1A2	P46721	670 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	CDH8	P55286	799 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	HIF1A	Q16665	826 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	LONRF1	Q17RB8	773 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	PKDCC	Q504Y2	493 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	XKR4	Q5GH76	650 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	SPRYD7	Q5W111	196 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	KAZN	Q674X7	775 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	MDM1	Q8TC05	714 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	ACTL9	Q8TC94	416 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	MAML1	Q92585	1016 aa		7.51	□□□□□ -1.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.7 ms