RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568530.5

PDPR-210, Transcript of pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPR, Length 7,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPR-210ENST00000568530 CCINQ13939 588 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 RELL1Q8IUW5 271 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 LNX2Q8N448 690 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 HDDC3Q8N4P3 179 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 ALLCQ8N6M5 410 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 AGPAT1Q99943 283 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 IL25Q9H293 177 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 KCTD10Q9H3F6 313 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 KLHL31Q9H511 634 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 YY1AP1Q9H869 796 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 IMPAD1Q9NX62 359 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 IP6K2Q9UHH9 426 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 STON1Q9Y6Q2 735 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 VWA5AO00534 786 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 CNPP09543 421 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 MSX1P28360 303 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 ACTR2P61160 394 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 MYBPC1Q00872 1141 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 RUNX1T1Q06455 604 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 COX10Q12887 443 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 INSCQ1MX18 579 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 HPS6Q86YV9 775 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 SPG21Q9NZD8 308 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 MYO3BQ8WXR4 1341 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 TRIM43BA6NCK2 446 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 OR10H2O60403 315 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 SLC25A12O75746 678 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 ALDH2P05091 517 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 PSMC6P62333 389 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 STX4Q12846 297 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 UBXN2BQ14CS0 331 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 ERMARDQ5T6L9 678 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 SCFD2Q8WU76 684 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 TPD52L3Q96J77 140 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 ROGDIQ9GZN7 287 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 RAD21L1Q9H4I0 556 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 SH3BP4Q9P0V3 963 aa8.72□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 SLC12A8A0AV02 714 aa8.71□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 EVPLLA8MZ36 301 aa8.71□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 QARSP47897 775 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 CPA2P48052 419 aa8.71□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 CEBPGP53567 150 aa8.71□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa8.71□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 RAP1GAP2Q684P5 730 aa8.71□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 GPD1LQ8N335 351 aa8.71□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 NAT16Q8N8M0 369 aa8.71□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 MCOLN3Q8TDD5 553 aa8.71□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 GAL3ST3Q96A11 431 aa8.71□□□□□ -1.01
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PDPR-210ENST00000568530 SNTNA6NMZ2 147 aa8.71□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 ERVV-1B6SEH8 477 aa8.71□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 HNF4AP41235 474 aa8.71□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 CCZ1BP86790 482 aa8.71□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 SPATA4Q8NEY3 305 aa8.71□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP8.71□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 CLCC1Q96S66 551 aa8.71□□□□□ -1.01
PDPR-210ENST00000568530 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
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PDPR-210ENST00000568530 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
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PDPR-210ENST00000568530 RRM2P31350 389 aa8.71□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 TGM3Q08188 693 aa8.71□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 TFDP2Q14188 446 aa8.71□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 USP49Q70CQ1 688 aa8.71□□□□□ -1.02
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PDPR-210ENST00000568530 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa8.71□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 ANKFN1Q8N957 763 aa8.71□□□□□ -1.02
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PDPR-210ENST00000568530 BIRC5O15392 142 aa8.71□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 SCN2BO60939 215 aa8.71□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 WASP42768 502 aa8.71□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 RHOAP61586 193 aa8.71□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 FOXM1Q08050 763 aa8.71□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa8.71□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 CALML6Q8TD86 181 aa8.71□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 CORO1BQ9BR76 489 aa8.71□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 TNKS2Q9H2K2 1166 aa8.71□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 INTS13Q9NVM9 706 aa8.71□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 RNF14Q9UBS8 474 aa8.71□□□□□ -1.02
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