RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 CLMPQ9H6B4 373 aa9.91□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 ABCB6Q9NP58 842 aa9.91□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 EHD2Q9NZN4 543 aa9.91□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa9.91□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 GCNT4Q9P109 453 aa9.91□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 SERTAD1Q9UHV2 236 aa9.91□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 DERAQ9Y315 318 aa9.91□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 HELZP42694 1942 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 CYSRT1A8MQ03 144 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 KPNA7A9QM74 516 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 ARHGAP6O43182 974 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 SMC2O95347 1197 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 PFKLP17858 780 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 ANXA13P27216 316 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 MAOBP27338 520 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 ITPKBP27987 946 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 NTSR1P30989 418 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 STAT6P42226 847 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 WASP42768 502 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 GAD2Q05329 585 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM119Q4V9L6 283 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 C10orf76Q5T2E6 689 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 RRAGBQ5VZM2 374 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 MARCH9Q86YJ5 346 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 SFTPA1Q8IWL2 248 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 CHPFQ8IZ52 775 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 PDILTQ8N807 584 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 LRRC15Q8TF66 581 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 DHX58Q96C10 678 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 PAGE5Q96GU1 130 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 RUSC1Q9BVN2 902 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 RBSNQ9H1K0 784 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 TMLHEQ9NVH6 421 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 DPP3Q9NY33 737 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 TBC1D14Q9P2M4 693 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 DEC1Q9P2X7 70 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 CPQQ9Y646 472 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 AK5Q9Y6K8 562 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD3-215ENST00000560424 NAV2Q8IVL1 2488 aa9.9□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 MYH11P35749 1972 aa9.89□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa9.89□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 ANO9A1A5B4 782 aa9.89□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 PLK4O00444 970 aa9.89□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
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SMAD3-215ENST00000560424 CILPO75339 1184 aa9.89□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF883P0CG24 379 aa9.89□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 PLCG1P19174 1290 aa9.89□□□□□ -0.83
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SMAD3-215ENST00000560424 HNF1BP35680 557 aa9.89□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 PNPLA4P41247 253 aa9.89□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 AMPD3Q01432 767 aa9.89□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 DPYDQ12882 1025 aa9.89□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 MAPK7Q13164 816 aa9.89□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 GAB4Q2WGN9 574 aa9.89□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 C4orf50Q6ZRC1 276 aa9.89□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 C1orf186Q6ZWK4 172 aa9.89□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 GPR155Q7Z3F1 870 aa9.89□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 C12orf40Q86WS4 652 aa9.89□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 KIAA1958Q8N8K9 716 aa9.89□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 NAT16Q8N8M0 369 aa9.89□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 ERLEC1Q96DZ1 483 aa9.89□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 ACBD6Q9BR61 282 aa9.89□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 LRRC27Q9C0I9 530 aa9.89□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 HAPLN2Q9GZV7 340 aa9.89□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 PRORYQ9H606 182 aa9.89□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 ASB7Q9H672 318 aa9.89□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 SMPD4Q9NXE4 827 aa9.89□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 C2CD2Q9Y426 696 aa9.89□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 BPTFQ12830 3046 aa9.89□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 A0A0A0MRY4 1105 aa9.88□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 PP2D1A8MPX8 630 aa9.88□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 TNFSF14O43557 240 aa9.88□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 NCAM1P13591 858 aa9.88□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 GUCY2CP25092 1073 aa9.88□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 CD6P30203 668 aa9.88□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 CDC25AP30304 524 aa9.88□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 GRIK1P39086 918 aa9.88□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 PPP3CCP48454 512 aa9.88□□□□□ -0.83
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF165P49910 485 aa9.88□□□□□ -0.83
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