RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557295.1

LINC00640-204, long intergenic non-protein coding RNA 640, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00640, Length 708 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00640-204ENST00000557295 NLRP4Q96MN2 994 aa7.47□□□□□ -1.21
LINC00640-204ENST00000557295 GAD1Q99259 594 aa7.47□□□□□ -1.21
LINC00640-204ENST00000557295 RIT2Q99578 217 aa7.47□□□□□ -1.21
LINC00640-204ENST00000557295 CLSTN3Q9BQT9 956 aa7.47□□□□□ -1.21
LINC00640-204ENST00000557295 SLC12A9Q9BXP2 914 aa7.47□□□□□ -1.21
LINC00640-204ENST00000557295 AP5S1Q9NUS5 200 aa7.47□□□□□ -1.21
LINC00640-204ENST00000557295 BARHL2Q9NY43 387 aa7.47□□□□□ -1.21
LINC00640-204ENST00000557295 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
LINC00640-204ENST00000557295 ADAM28Q9UKQ2 775 aa7.47□□□□□ -1.21
LINC00640-204ENST00000557295 IPPQ9Y573 584 aa7.47□□□□□ -1.21
LINC00640-204ENST00000557295 U3KQE9 123 aa7.47□□□□□ -1.21
LINC00640-204ENST00000557295 LAMA4Q16363 1823 aa7.47□□□□□ -1.21
LINC00640-204ENST00000557295 FANCMQ8IYD8 2048 aa7.47□□□□□ -1.21
LINC00640-204ENST00000557295 A0A1W2PQ27 194 aa7.46□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 A0A1W2PQ64 194 aa7.46□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 A0A1W2PQC6 194 aa7.46□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 A0A1W2PQD8 194 aa7.46□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 PRR19A6NJB7 356 aa7.46□□□□□ -1.22
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LINC00640-204ENST00000557295 FCARP24071 287 aa7.46□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 MCM5P33992 734 aa7.46□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 FLT3P36888 993 aa7.46□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 MLH1P40692 756 aa7.46□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 RAP1GAPP47736 663 aa7.46□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 SCNN1GP51170 649 aa7.46□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 PTH1RQ03431 593 aa7.46□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 PRR16Q569H4 304 aa7.46□□□□□ -1.22
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LINC00640-204ENST00000557295 C1orf228Q6PIY5 440 aa7.46□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
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LINC00640-204ENST00000557295 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa7.46□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 WDR5BQ86VZ2 330 aa7.46□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 CHD1LQ86WJ1 897 aa7.46□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 SMC5Q8IY18 1101 aa7.46□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 GSTCDQ8NEC7 633 aa7.46□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 RDM1Q8NG50 284 aa7.46□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 SLC7A14Q8TBB6 771 aa7.46□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 CCDC51Q96ER9 411 aa7.46□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 MSANTD3Q96H12 275 aa7.46□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 TTPALQ9BTX7 342 aa7.46□□□□□ -1.22
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LINC00640-204ENST00000557295 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa7.46□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 BRD9Q9H8M2 597 aa7.46□□□□□ -1.22
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LINC00640-204ENST00000557295 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
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LINC00640-204ENST00000557295 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa7.46□□□□□ -1.22
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LINC00640-204ENST00000557295 GIT1Q9Y2X7 761 aa7.46□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa7.46□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 PIAS3Q9Y6X2 628 aa7.46□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.22
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LINC00640-204ENST00000557295 RFPL3O75679 317 aa7.45□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 ZNF205O95201 554 aa7.45□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 SCG5P05408 212 aa7.45□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 RHOP08100 348 aa7.45□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 PLS3P13797 630 aa7.45□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 NUCB1Q02818 461 aa7.45□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 LAPTM5Q13571 262 aa7.45□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 LRRC32Q14392 662 aa7.45□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 SLC5A9Q2M3M2 681 aa7.45□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 FAM78AQ5JUQ0 283 aa7.45□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa7.45□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 ERICH6BQ5W0A0 696 aa7.45□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 PDXDC1Q6P996 788 aa7.45□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa7.45□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 SGMS1Q86VZ5 419 aa7.45□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 ING5Q8WYH8 240 aa7.45□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 DIO2Q92813 273 aa7.45□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 SLC5A5Q92911 643 aa7.45□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 MCRS1Q96EZ8 462 aa7.45□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 UNC45AQ9H3U1 944 aa7.45□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa7.45□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa7.45□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 IGF2RP11717 2491 aa7.45□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 DOCK5Q9H7D0 1870 aa7.45□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa7.45□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 SCO2A0A1W2PP80 73 aa7.44□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 ESYT2A0FGR8 921 aa7.44□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 ARNTLO00327 626 aa7.44□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 MSH4O15457 936 aa7.44□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 ADAM12O43184 909 aa7.44□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 CHMP2AO43633 222 aa7.44□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 OPA1O60313 960 aa7.44□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 TSPAN1O60635 241 aa7.44□□□□□ -1.22
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