RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553301.1

AL845552.2-201, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene AL845552.2, Length 553 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AL845552.2-201ENST00000553301 RALAP11233 206 aa22.09■■□□□ 1.13
AL845552.2-201ENST00000553301 CD19P15391 556 aa22.09■■□□□ 1.13
AL845552.2-201ENST00000553301 GJA4P35212 333 aa22.09■■□□□ 1.13
AL845552.2-201ENST00000553301 NRLP54845 237 aa22.09■■□□□ 1.13
AL845552.2-201ENST00000553301 BST2Q10589 180 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
AL845552.2-201ENST00000553301 TMEM196Q5HYL7 178 aa22.09■■□□□ 1.13
AL845552.2-201ENST00000553301 LMO3Q8TAP4 145 aa22.09■■□□□ 1.13
AL845552.2-201ENST00000553301 SMPD4Q9NXE4 827 aa22.09■■□□□ 1.13
AL845552.2-201ENST00000553301 CLIC5Q9NZA1 410 aa22.09■■□□□ 1.13
AL845552.2-201ENST00000553301 CFAP97Q9P2B7 532 aa22.09■■□□□ 1.13
AL845552.2-201ENST00000553301 TSPAN16Q9UKR8 245 aa22.09■■□□□ 1.13
AL845552.2-201ENST00000553301 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa22.09■■□□□ 1.13
AL845552.2-201ENST00000553301 PATJQ8NI35 1801 aa22.08■■□□□ 1.13
AL845552.2-201ENST00000553301 HELZP42694 1942 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
AL845552.2-201ENST00000553301 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
AL845552.2-201ENST00000553301 ATG13O75143 517 aa22.08■■□□□ 1.13
AL845552.2-201ENST00000553301 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
AL845552.2-201ENST00000553301 TMEM270Q6UE05 265 aa22.08■■□□□ 1.13
AL845552.2-201ENST00000553301 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa22.08■■□□□ 1.13
AL845552.2-201ENST00000553301 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
AL845552.2-201ENST00000553301 P2RY13Q9BPV8 354 aa22.08■■□□□ 1.13
AL845552.2-201ENST00000553301 CCSER2Q9H7U1 834 aa22.08■■□□□ 1.13
AL845552.2-201ENST00000553301 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa22.08■■□□□ 1.13
AL845552.2-201ENST00000553301 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa22.08■■□□□ 1.13
AL845552.2-201ENST00000553301 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 CYP26A1O43174 497 aa22.07■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 ADH1CP00326 375 aa22.07■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 CXCL12P48061 93 aa22.07■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 ZXDBP98169 803 aa22.07■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa22.07■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 RAB41Q5JT25 222 aa22.07■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 PIGZQ86VD9 579 aa22.07■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.07■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 CD101Q93033 1021 aa22.07■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 ZSCAN32Q9NX65 697 aa22.07■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 DNMT3LQ9UJW3 386 aa22.07■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 O00370 1275 aa22.06■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 DPCR1Q3MIW9 517 aa22.06■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 PHOX2BQ99453 314 aa22.06■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 LRRC4Q9HBW1 653 aa22.06■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 NAGPAQ9UK23 515 aa22.06■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 MYH10P35580 1976 aa22.05■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 A0A1W2PQH9 124 aa22.05■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 GFRA3O60609 400 aa22.05■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 RARGP13631 454 aa22.05■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 PLA2G4AP47712 749 aa22.05■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 LCLAT1Q6UWP7 414 aa22.05■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 GBP6Q6ZN66 633 aa22.05■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 TTC30AQ86WT1 665 aa22.05■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa22.05■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 ATRIPQ8WXE1 791 aa22.05■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 NELL1Q92832 810 aa22.05■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 LINC00597Q9H2U6 94 aa22.05■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 MBD3O95983 291 aa22.04■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 MFAP3P55082 362 aa22.04■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 CNGA2Q16280 664 aa22.04■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 MEA1Q16626 185 aa22.04■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 MAN2A1Q16706 1144 aa22.04■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 EXOC3L4Q17RC7 722 aa22.04■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 FSTL4Q6MZW2 842 aa22.04■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 RRAGAQ7L523 313 aa22.04■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 SCML4Q8N228 414 aa22.04■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 KCTD13Q8WZ19 329 aa22.04■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 CNTN6Q9UQ52 1028 aa22.04■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 PRR23AA6NEV1 266 aa22.03■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 ZBED1O96006 694 aa22.03■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 CYP17A1P05093 508 aa22.03■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 GALK1P51570 392 aa22.03■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 TKTL1P51854 596 aa22.03■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 ZNF132P52740 706 aa22.03■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 COG7P83436 770 aa22.03■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 PDE4CQ08493 712 aa22.03■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 DHCR24Q15392 516 aa22.03■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 C10orf120Q5SQS8 335 aa22.03■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 PM20D1Q6GTS8 502 aa22.03■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 TRIM65Q6PJ69 517 aa22.03■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 HTR3DQ70Z44 454 aa22.03■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa22.03■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 ZBTB44Q8NCP5 570 aa22.03■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 CHFRQ96EP1 664 aa22.03■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 MED15Q96RN5 788 aa22.03■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 CNGB3Q9NQW8 809 aa22.03■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 ZNF510Q9Y2H8 683 aa22.03■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa22.03■■□□□ 1.12
AL845552.2-201ENST00000553301 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms