RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	GNA14	O95837	355 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	EGF	P01133	1207 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	ADORA2B	P29275	332 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	OPRD1	P41143	372 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	PGF	P49763	221 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	CUL2	Q13617	745 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	DHCR24	Q15392	516 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	LONP2	Q86WA8	852 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	LMO3	Q8TAP4	145 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	NELFB	Q8WX92	580 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	GREM1	O60565	184 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	TLR5	O60602	858 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	CYP17A1	P05093	508 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	ZNF394	Q53GI3	561 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	RAB41	Q5JT25	222 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	ISM2	Q6H9L7	571 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	HTR3D	Q70Z44	454 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	SYT13	Q7L8C5	426 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	12.11	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	OSER1	Q9NX31	292 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	CACNA1A	O00555	2505 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	CYP26A1	O43174	497 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	RNF40	O75150	1001 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	ADH1C	P00326	375 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	PAEP	P09466	180 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	GCNT1	Q02742	428 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	CETN1	Q12798	172 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	PAK1	Q13153	545 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	NMUR1	Q9HB89	426 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137		A0A1W2PQH9	124 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137		K7EQS6	105 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	BIN1	O00499	593 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	HR	O43593	1189 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	TBX18	O95935	607 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	VDR	P11473	427 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	PLA2G4A	P47712	749 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	FNTB	P49356	437 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	SLC8A3	P57103	927 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	GAD2	Q05329	585 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	SGO2	Q562F6	1265 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	SCD5	Q86SK9	330 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	PIGZ	Q86VD9	579 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	TTC30A	Q86WT1	665 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	SCML4	Q8N228	414 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	TTC16	Q8NEE8	873 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	USP33	Q8TEY7	942 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	ACD	Q96AP0	544 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	NT5C1B	Q96P26	610 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	PNKP	Q96T60	521 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	EBF1	Q9UH73	591 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		12.09	□□□□□ -0.47

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