RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 SDHAF4Q5VUM1 108 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 ISM2Q6H9L7 571 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 SASS6Q6UVJ0 657 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 GBP6Q6ZN66 633 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 CLEC17AQ6ZS10 378 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 C11orf74Q86VG3 221 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 PPM1KQ8N3J5 372 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF276Q8N554 614 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 ANKRD52Q8NB46 1076 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 SUMF1Q8NBK3 374 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 MSANTD4Q8NCY6 345 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 KCNV2Q8TDN2 545 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 SH3RF2Q8TEC5 729 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 RNF139Q8WU17 664 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC35C1Q96A29 364 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 P2RY13Q9BPV8 354 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 FOXQ1Q9C009 403 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 CHRDQ9H2X0 955 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 DPEP3Q9H4B8 488 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 CLSTN2Q9H4D0 955 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 THAP9Q9H5L6 903 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 ECT2Q9H8V3 914 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM49BQ9NUQ9 324 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 CLIC5Q9NZA1 410 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 WDR35Q9P2L0 1181 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 NAGPAQ9UK23 515 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 GMEB2Q9UKD1 530 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 ANK1P16157 1881 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 LOC400499M0QZD8 3231 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM92AA1XBS5 289 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 LEFTY2O00292 366 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 CLDN5O00501 218 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 NPC1O15118 1278 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 PI15O43692 258 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 TLR5O60602 858 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 PRAMEF12O95522 483 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 ZBED1O96006 694 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 OAS1P00973 400 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 APODP05090 189 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 DESP17661 470 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 RAP1GAPP47736 663 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 HARS2P49590 506 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 GPR15P49685 360 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 TPM4P67936 248 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 SHC2P98077 582 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 USP4Q13107 963 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 PON2Q15165 354 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF77Q15935 545 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 MEA1Q16626 185 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 EXOC3L4Q17RC7 722 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF394Q53GI3 561 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 C10orf120Q5SQS8 335 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 FKBP15Q5T1M5 1219 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 STXBP5Q5T5C0 1151 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 ARHGAP17Q68EM7 881 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 SPOPLQ6IQ16 392 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 SDE2Q6IQ49 451 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 TTI2Q6NXR4 508 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM270Q6UE05 265 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 CLEC20AQ6ZU45 233 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC186Q7Z3E2 898 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 FUKQ8N0W3 1084 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM130Q8N3G9 435 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 CAMKK1Q8N5S9 505 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 EHBP1Q8NDI1 1231 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 PLEKHO2Q8TD55 490 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 UCMAQ8WVF2 138 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 CD101Q93033 1021 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 EEF2KMTQ96G04 330 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 HSFY1Q96LI6 401 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 MED15Q96RN5 788 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 CYP2S1Q96SQ9 504 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 KCNK16Q96T55 309 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM83CQ9BQN1 747 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 SMOC2Q9H3U7 446 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 EBF3Q9H4W6 596 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 CNGB3Q9NQW8 809 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 GTSE1Q9NYZ3 720 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 IL37Q9NZH6 218 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 GCNT4Q9P109 453 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 CPQQ9Y646 472 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 R4GN57 208 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 DOCK6Q96HP0 2047 aa5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.4 ms