RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544244.5

PTPRO-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRO, Length 3,978 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-210ENST00000544244 TWF1Q12792 350 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 CFAP221Q4G0U5 840 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 C2CD6Q53TS8 623 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 CES5AQ6NT32 575 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 SLC35F6Q8N357 371 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 CXorf38Q8TB03 319 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 SLC7A14Q8TBB6 771 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 SPPL3Q8TCT6 385 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 IRGQQ8WZA9 623 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 TMEM209Q96SK2 561 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 GDF15Q99988 308 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 CNPY3Q9BT09 278 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 PACSIN1Q9BY11 444 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 RASAL2Q9UJF2 1139 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 JRKLQ9Y4A0 524 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 HYOU1Q9Y4L1 999 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 YIPF1Q9Y548 306 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 SIGLEC16A6NMB1 481 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 SLC38A8A6NNN8 435 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 TEX28O15482 410 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 KRT1P04264 644 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 ARL4AP40617 200 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 PLA2G4AP47712 749 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 PTPN20Q4JDL3 420 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 EFHC2Q5JST6 749 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 PMF1Q6P1K2 205 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 FAM171BQ6P995 826 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 MON1AQ86VX9 555 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 TTC30AQ86WT1 665 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF354CQ86Y25 554 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 RHOT1Q8IXI2 618 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 KCTD6Q8NC69 237 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 RXFP2Q8WXD0 754 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 KCTD13Q8WZ19 329 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 CASP10Q92851 521 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 CORO1BQ9BR76 489 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 ATXN3LQ9H3M9 355 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 POPDC2Q9HBU9 364 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 PNPLA8Q9NP80 782 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 ABCC13Q9NSE7 274 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 LCHNA4D1U4 455 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 PJA2O43164 708 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 FTCDO95954 541 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 CYP1A2P05177 515 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 CNPP09543 421 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 NUDT7P0C024 238 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 ATF2P15336 505 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 TCP1P17987 556 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 CDC25CP30307 473 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 PPP3CCP48454 512 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 SLC5A3P53794 718 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 RWDD2BP57060 319 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 KIAA0319Q5VV43 1072 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 SLC8B1Q6J4K2 584 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 LRRC31Q6UY01 552 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 CLEC20AQ6ZU45 233 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 DEFB106AQ8N104 65 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 PAF1Q8N7H5 531 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 CPXM1Q96SM3 734 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 SLC4A5Q9BY07 1137 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 ZWILCHQ9H900 591 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 DONSONQ9NYP3 566 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 PCDH10Q9P2E7 1040 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 PCSK1NQ9UHG2 260 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 H3BNC9 293 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 M0QYT0 321 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 KCNK3O14649 394 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 GRM6O15303 877 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 B4GALT3O60512 393 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 ERBB2P04626 1255 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 UNGP13051 313 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 PTPN2P17706 415 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 BMP8BP34820 402 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 NOS2P35228 1153 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 NRIP1P48552 1158 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 HECTD3Q5T447 861 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 SCARA3Q6AZY7 606 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 GPR152Q8TDT2 470 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 SLC35F5Q8WV83 523 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67 ms