RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534198.1

RBM4B-208, Transcript of RNA binding motif protein 4B, human

TSL 3

Gene RBM4B, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM4B-208	ENST00000534198	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	PTPRD	P23468	1912 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	THADA	Q6YHU6	1953 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	NUP205	Q92621	2012 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	WASH3P	C4AMC7	463 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF217	O75362	1048 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	ABL1	P00519	1130 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	SYP	P08247	313 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	HOXB2	P14652	356 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	YWHAQ	P27348	245 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	MYO1E	Q12965	1108 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	CAMK2B	Q13554	666 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	HTR3D	Q70Z44	454 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	GPD1L	Q8N335	351 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF516	Q92618	1163 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	IL21R	Q9HBE5	538 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	EHD2	Q9NZN4	543 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	DKK4	Q9UBT3	224 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	FBXO10	Q9UK96	956 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	RAX	Q9Y2V3	346 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	RAD54B	Q9Y620	910 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	ANK1	P16157	1881 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198		A0A087X0B3	334 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	GCNT3	O95395	438 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	TBX18	O95935	607 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	GAP43	P17677	238 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	ANXA13	P27216	316 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	GJB2	P29033	226 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	GRIK2	Q13002	908 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	HECTD3	Q5T447	861 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	9.22	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	NAXD	Q8IW45	347 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	TMX3	Q96JJ7	454 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	CLIC6	Q96NY7	704 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	MMS19	Q96T76	1030 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	STK17A	Q9UEE5	414 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	CLIC4	Q9Y696	253 aa		9.22	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		9.21	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	OBSL1	O75147	1896 aa		9.21	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		9.21	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF233	A6NK53	670 aa		9.21	□□□□□ -0.94
RBM4B-208	ENST00000534198	KCNJ18	B7U540	433 aa		9.21	□□□□□ -0.94
RBM4B-208	ENST00000534198	TGFB1I1	O43294	461 aa		9.21	□□□□□ -0.94
RBM4B-208	ENST00000534198	CACNG3	O60359	315 aa		9.21	□□□□□ -0.94
RBM4B-208	ENST00000534198	BEST1	O76090	585 aa		9.21	□□□□□ -0.94
RBM4B-208	ENST00000534198	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	9.21	□□□□□ -0.94
RBM4B-208	ENST00000534198	TUB	P50607	506 aa		9.21	□□□□□ -0.94
RBM4B-208	ENST00000534198	CDH8	P55286	799 aa		9.21	□□□□□ -0.94
RBM4B-208	ENST00000534198	ENPP2	Q13822	863 aa		9.21	□□□□□ -0.94
RBM4B-208	ENST00000534198	ANO4	Q32M45	955 aa		9.21	□□□□□ -0.94
RBM4B-208	ENST00000534198	SV2B	Q7L1I2	683 aa		9.21	□□□□□ -0.94
RBM4B-208	ENST00000534198	WDR49	Q8IV35	697 aa		9.21	□□□□□ -0.94
RBM4B-208	ENST00000534198	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		9.21	□□□□□ -0.94
RBM4B-208	ENST00000534198	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	9.21	□□□□□ -0.94
RBM4B-208	ENST00000534198	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		9.21	□□□□□ -0.94
RBM4B-208	ENST00000534198	HPS3	Q969F9	1004 aa		9.21	□□□□□ -0.94
RBM4B-208	ENST00000534198	FBXO32	Q969P5	355 aa		9.21	□□□□□ -0.94
RBM4B-208	ENST00000534198	COL26A1	Q96A83	441 aa		9.21	□□□□□ -0.94
RBM4B-208	ENST00000534198	CRELD1	Q96HD1	420 aa		9.21	□□□□□ -0.94
RBM4B-208	ENST00000534198	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		9.21	□□□□□ -0.94

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