RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531461.5

ACER3-211, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 1,292 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-211ENST00000531461 KRT82Q9NSB4 513 aa25.43■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 MAPK13O15264 365 aa25.42■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 AP1G2O75843 785 aa25.42■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 ASS1P00966 412 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 CMA1P23946 247 aa25.42■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 EOGTQ5NDL2 527 aa25.42■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 RNF43Q68DV7 783 aa25.42■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa25.42■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 SV2AQ7L0J3 742 aa25.42■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 ALLCQ8N6M5 410 aa25.42■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 SMOQ99835 787 aa25.42■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 CCSER2Q9H7U1 834 aa25.42■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa25.42■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 HPSEQ9Y251 543 aa25.42■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa25.42■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP25.41■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 NFIL3Q16649 462 aa25.41■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 TCEAL6Q6IPX3 200 aa25.41■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 SFTPA1Q8IWL2 248 aa25.41■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 TCEAL3Q969E4 200 aa25.41■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 EDEM2Q9BV94 578 aa25.41■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 GMIPQ9P107 970 aa25.41■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 SGK1O00141 431 aa25.4■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 BEST1O76090 585 aa25.4■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 PFKFB1P16118 471 aa25.4■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 PMLP29590 882 aa25.4■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 TIE1P35590 1138 aa25.4■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 ASPAP45381 313 aa25.4■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 NDST1P52848 882 aa25.4■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 ENPEPQ07075 957 aa25.4■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 SLC2A14Q8TDB8 520 aa25.4■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 WHAMMQ8TF30 809 aa25.4■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 SPHK2Q9NRA0 654 aa25.4■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa25.4■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 LNP1A1A4G5 178 aa25.39■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 CLSTN1O94985 981 aa25.39■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 KIF20AO95235 890 aa25.39■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 CCDC130P13994 396 aa25.39■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 BCKDHBP21953 392 aa25.39■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 P2RY2P41231 377 aa25.39■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 SHC2P98077 582 aa25.39■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 INCA1Q0VD86 236 aa25.39■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 C1orf220Q5T0J3 134 aa25.39■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 BTBD8Q5XKL5 378 aa25.39■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 BBS7Q8IWZ6 715 aa25.39■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 ELMO3Q96BJ8 720 aa25.39■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 CYLDQ9NQC7 956 aa25.39■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 HMGXB4Q9UGU5 601 aa25.39■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 INVSQ9Y283 1065 aa25.39■■□□□ 1.66
ACER3-211ENST00000531461 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa25.38■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 A0A1B0GVL5 298 aa25.38■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 CALUO43852 315 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 TLR5O60602 858 aa25.38■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 ADAM23O75077 832 aa25.38■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 KCNK5O95279 499 aa25.38■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 PI4KAP42356 2102 aa25.38■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 SPDYCQ5MJ68 293 aa25.38■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 EMC10Q5UCC4 262 aa25.38■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 NUDT18Q6ZVK8 323 aa25.38■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 HTR3DQ70Z44 454 aa25.38■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 PNPLA8Q9NP80 782 aa25.38■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 DEC1Q9P2X7 70 aa25.38■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa25.38■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 GREM1O60565 184 aa25.37■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 TULP3O75386 442 aa25.37■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 RHOBTB3O94955 611 aa25.37■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 HLA-DRAP01903 254 aa25.37■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 MAP3K7CLP57077 242 aa25.37■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 KDSRQ06136 332 aa25.37■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
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ACER3-211ENST00000531461 CYP2U1Q7Z449 544 aa25.37■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 C12orf29Q8N999 325 aa25.37■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 SPACA7Q96KW9 195 aa25.37■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 NACA2Q9H009 215 aa25.37■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 CYP3A43Q9HB55 503 aa25.37■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 SCML2Q9UQR0 700 aa25.37■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 STARD13Q9Y3M8 1113 aa25.37■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 TBC1D3BA6NDS4 549 aa25.36■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 FAM200BP0CF97 657 aa25.36■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 PIK3CAP42336 1068 aa25.36■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 PGFP49763 221 aa25.36■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 VAMP7P51809 220 aa25.36■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa25.36■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 SPOPLQ6IQ16 392 aa25.36■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 KLHDC10Q6PID8 442 aa25.36■■□□□ 1.65
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