RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DNAI1Q9UI46 699 aa8.92□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM59LQ9UK28 342 aa8.92□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FBXW11Q9UKB1 542 aa8.92□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AMFRQ9UKV5 643 aa8.92□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SCML2Q9UQR0 700 aa8.92□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 INSL5Q9Y5Q6 135 aa8.92□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 USP3Q9Y6I4 520 aa8.92□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A1W2PQH9 124 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C2CD4BA6NLJ0 364 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPOPO43791 374 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DAB1O75553 588 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PROSCO94903 275 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FTCDO95954 541 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C1RP00736 705 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LTFP02788 710 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TUBB4AP04350 444 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NCAM1P13591 858 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EPCAMP16422 314 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SDC4P31431 198 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SCNN1AP37088 669 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ETF1P62495 437 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TAF10Q12962 218 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DCAF6Q58WW2 860 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SYT10Q6XYQ8 523 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NYAP1Q6ZVC0 841 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HFE2Q6ZVN8 426 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PEX26Q7Z412 305 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MON1AQ86VX9 555 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DEFB106AQ8N104 65 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SCML4Q8N228 414 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC22A17Q8WUG5 538 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EDEM1Q92611 657 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP8.91□□□□□ -0.984e-7■■□□□ 13.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLITRK1Q96PX8 696 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CNPY3Q9BT09 278 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRIM62Q9BVG3 475 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 POPDC2Q9HBU9 364 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IL37Q9NZH6 218 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GMIPQ9P107 970 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DPP7Q9UHL4 492 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LCMT1Q9UIC8 334 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HYOU1Q9Y4L1 999 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ASB3Q9Y575 518 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ALG6Q9Y672 507 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CTAGE9A4FU28 777 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CCL16O15467 120 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZMYND10O75800 440 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RNF8O76064 485 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RALAP11233 206 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 COMTP21964 271 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NOS2P35228 1153 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FLT3P36888 993 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MATKP42679 507 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC1A1P43005 524 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SULT1E1P49888 294 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DNA2P51530 1060 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ATP11AP98196 1134 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OGDHQ02218 1023 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RPS6KA1Q15418 735 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DUSP6Q16828 381 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CDO1Q16878 200 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CCDC14Q49A88 953 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF697Q5TEC3 545 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SYPL2Q5VXT5 272 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C11orf63Q6NUN7 778 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SCYL2Q6P3W7 929 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RTL10Q7L3V2 364 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ARCQ7LC44 396 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SCD5Q86SK9 330 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LRRC57Q8N9N7 239 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RNF139Q8WU17 664 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HDAC7Q8WUI4 952 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CFAP57Q96MR6 1250 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC2A13Q96QE2 648 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 WDR24Q96S15 920 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GOLPH3Q9H4A6 298 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRDM12Q9H4Q4 367 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NMUR1Q9HB89 426 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ABCC13Q9NSE7 274 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 COX16Q9P0S2 106 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 STAP1Q9ULZ2 295 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 JRKLQ9Y4A0 524 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TSC2P49815 1807 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 M0QYT0 321 aa8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms