RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529524.1

PSMA1-208, Transcript of proteasome subunit alpha 1, human

TSL 3

Gene PSMA1, Length 743 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA1-208	ENST00000529524	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	STK31	Q9BXU1	1019 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	TRIM5	Q9C035	493 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	CLIC1	O00299	241 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	EXOC5	O00471	708 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	SPRY2	O43597	315 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	STIM1	Q13586	685 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	NPNT	Q6UXI9	565 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	TPH2	Q8IWU9	490 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	SUCLG2	Q96I99	432 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	AIFM3	Q96NN9	605 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	DPH1	Q9BZG8	443 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524		H7C4K7	107 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	OAZ2	O95190	189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	GATM	P50440	423 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	PGD	P52209	483 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	EPHB1	P54762	984 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	STK3	Q13188	491 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	MIDN	Q504T8	468 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	ODR4	Q5SWX8	454 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	OR56A3	Q8NH54	315 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	IL31RA	Q8NI17	732 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	USP29	Q9HBJ7	922 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	HEY2	Q9UBP5	337 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	ERCC6	Q03468	1493 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	CFAP69	A5D8W1	941 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	TLR2	O60603	784 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	PIAS2	O75928	621 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	ALPL	P05186	524 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	HGF	P14210	728 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	BRAF	P15056	766 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	CD19	P15391	556 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	CPA2	P48052	419 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	CFHR3	Q02985	330 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	SEC23B	Q15437	767 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	TAAR9	Q96RI9	348 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	USP19	O94966	1318 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	CAPN8	A6NHC0	703 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	RAB27B	O00194	218 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	TBX3	O15119	743 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	CCP110	O43303	1012 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	CTSA	P10619	480 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	PSG1	P11464	419 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	RAB27A	P51159	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	YPEL5	P62699	121 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	ARHGEF7	Q14155	803 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	SLC29A2	Q14542	456 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		4.88	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms