RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528470.5

RRM1-206, Transcript of ribonucleotide reductase catalytic subunit M1, human

TSL 3

Gene RRM1, Length 579 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRM1-206	ENST00000528470	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	RTKN	Q9BST9	563 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	VPS33B	Q9H267	617 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	EPC1	Q9H2F5	836 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	NOD2	Q9HC29	1040 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	JKAMP	Q9P055	326 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	FEM1B	Q9UK73	627 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	PSME4	Q14997	1843 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	CACNA1F	O60840	1977 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	LTBP1	Q14766	1721 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	AQP7P3	A6NL99	342 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	TMEM233	B4DJY2	109 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	TISP43	B9A030	160 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470		B9A039	149 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	CCP110	O43303	1012 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	TMCC2	O75069	709 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	TOX4	O94842	621 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	HAUS5	O94927	633 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	TBX18	O95935	607 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	KNG1	P01042	644 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	RXRA	P19793	462 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	BCAT1	P54687	386 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	WNT3	P56703	355 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	ADAM9	Q13443	819 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	HLF	Q16534	295 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	CCNG2	Q16589	344 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	PARP10	Q53GL7	1025 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	USP49	Q70CQ1	688 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	RFFL	Q8WZ73	363 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	RSC1A1	Q92681	617 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	GOLGA1	Q92805	767 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	SCAMP4	Q969E2	229 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	SDF4	Q9BRK5	362 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	MRI1	Q9BV20	369 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	GPR35	Q9HC97	309 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	NCDN	Q9UBB6	729 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	XPR1	Q9UBH6	696 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	JAG2	Q9Y219	1238 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	PASK	Q96RG2	1323 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	COL4A5	P29400	1685 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	ABCC12	Q96J65	1359 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	TAF1	P21675	1872 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	MYH3	P11055	1940 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470		A0A087X0M5	115 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470		A0A1B0GX30	115 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	FSD2	A1L4K1	749 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470		M0QYG6	137 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	TIPRL	O75663	272 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	SASH1	O94885	1247 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	KLHL18	O94889	574 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	NTSR2	O95665	410 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	AMH	P03971	560 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	TK1	P04183	234 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	HOXB7	P09629	217 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	ATP1A3	P13637	1013 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	VIPR1	P32241	457 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	MRE11	P49959	708 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	TUB	P50607	506 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	NPEPPS	P55786	919 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	BPIFB4	P59827	614 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	SCAP	Q12770	1279 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-206	ENST00000528470	CUL4B	Q13620	913 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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