RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PCDHA7Q9UN72 937 aa1.3□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A1B0GUV1 79 aa1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLEC18AA5D8T8 446 aa1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KLHL33A6NCF5 533 aa1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM233B4DJY2 109 aa1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLIC1O00299 241 aa1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPTLC2O15270 562 aa1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRAMEF2O60811 474 aa1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MBPP02686 304 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UMODP07911 640 aa1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PGGT1BP53609 377 aa1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ADKP55263 362 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RRP1P56182 461 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STIM1Q13586 685 aa1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MFSD13AQ14CX5 517 aa1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LCE3AQ5TA76 89 aa1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANO7Q6IWH7 933 aa1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRILQ7L0X0 811 aa1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FBXL14Q8N1E6 418 aa1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRR18Q8N4B5 295 aa1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 METTL25Q8N6Q8 603 aa1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLEC18CQ8NCF0 446 aa1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BPIFB1Q8TDL5 484 aa1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MED30Q96HR3 178 aa1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF556Q9HAH1 456 aa1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CD93Q9NPY3 652 aa1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LMBRD1Q9NUN5 540 aa1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM45AQ9NWC5 275 aa1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PCDHA6Q9UN73 950 aa1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SHOC2Q9UQ13 582 aa1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP1.29□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A087WWL8 130 aa1.28□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A6NNC1 897 aa1.28□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ACOT8O14734 319 aa1.28□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GABRDO14764 452 aa1.28□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FYB1O15117 783 aa1.28□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 INPPL1O15357 1258 aa1.28□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLAUP00749 431 aa1.28□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FTLP02792 175 aaPredicted RBP1.28□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP1.28□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MYBL2P10244 700 aa1.28□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CD19P15391 556 aa1.28□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LRPAP1P30533 357 aa1.28□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IDUAP35475 653 aa1.28□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POLD2P49005 469 aa1.28□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPC5P78333 572 aa1.28□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HSF1Q00613 529 aa1.28□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DDR1Q08345 913 aa1.28□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MANEAQ5SRI9 462 aa1.28□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRSS57Q6UWY2 283 aa1.28□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa1.28□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RTL10Q7L3V2 364 aa1.28□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa1.28□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GAS2L3Q86XJ1 694 aa1.28□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HOMEZQ8IX15 550 aa1.28□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM199Q8N511 208 aa1.28□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IQCF1Q8N6M8 205 aa1.28□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DNAJB14Q8TBM8 379 aa1.28□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATP2A3Q93084 1043 aa1.28□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP1.28□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TUBB6Q9BUF5 446 aa1.28□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPRY4Q9C004 299 aa1.28□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RMI1Q9H9A7 625 aa1.28□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SEMA5BQ9P283 1151 aa1.28□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRHDEQ9UKU6 1024 aa1.28□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP1.28□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POLHQ9Y253 713 aa1.28□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 INSL5Q9Y5Q6 135 aa1.28□□□□□ -2.2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 H0YGN5 161 aa1.27□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP1.27□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARIH2O95376 493 aa1.27□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HGFP14210 728 aa1.27□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PDCP20941 246 aa1.27□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UQCRC1P31930 480 aa1.27□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP1.27□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 COMPP49747 757 aaPredicted RBP1.27□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARFIP2P53365 341 aa1.27□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BCAT1P54687 386 aa1.27□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GAS1P54826 345 aa1.27□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DSCR9P59020 149 aa1.27□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ERVFC1-1P60608 527 aa1.27□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KRT85P78386 507 aa1.27□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms