RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 LAMP2P13473 410 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF18P17022 549 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 SOX9P48436 509 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 TNK2Q07912 1038 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC5A9Q2M3M2 681 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 VWA3BQ502W6 1294 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 TANGO2Q6ICL3 276 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 FGF14Q92915 247 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 RXFP1Q9HBX9 757 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 GTSE1Q9NYZ3 720 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 TSPAN16Q9UKR8 245 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 WNT6Q9Y6F9 365 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 HEPACAM2A8MVW5 462 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 M0QZQ0 153 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 DCNP07585 359 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 CDC25CP30307 473 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 GJC1P36383 396 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 TKTL1P51854 596 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 TDGQ13569 410 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 KRT31Q15323 416 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 KLHL40Q2TBA0 621 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM31Q5JXX7 168 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC9A9Q8IVB4 645 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 ARHGEF19Q8IW93 802 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 TCEAL8Q8IYN2 117 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 EHBP1Q8NDI1 1231 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 SIK2Q9H0K1 926 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF358Q9NW07 568 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 DMAC2Q9NW81 257 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 EFR3BQ9Y2G0 817 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 RALAP11233 206 aa6.88□□□□□ -1.31
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RRN3P1-201ENST00000514813 KLK7P49862 253 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC5A3P53794 718 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 ZP2Q05996 745 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 ADIGQ0VDE8 80 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 NME3Q13232 169 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 CDO1Q16878 200 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 COX20Q5RI15 118 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 SCUBE3Q8IX30 993 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 NPAS3Q8IXF0 933 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 NUP93Q8N1F7 819 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
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RRN3P1-201ENST00000514813 GMIPQ9P107 970 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 STRIP2Q9ULQ0 834 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 TRIP11Q15643 1979 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC12A8A0AV02 714 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 C2orf78A6NCI8 922 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 TLR5O60602 858 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 TSPAN3O60637 253 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 SCTRP47872 440 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 MYBPC2Q14324 1141 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 LPAL2Q16609 132 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 CTC1Q2NKJ3 1217 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 C2orf27AQ580R0 203 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 XKR4Q5GH76 650 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 TCP11X2Q5H9J9 407 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 SCYL2Q6P3W7 929 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 CD300LGQ6UXG3 332 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 TPRG1Q6ZUI0 275 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 PIGZQ86VD9 579 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 SPC24Q8NBT2 197 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 B3GNT5Q9BYG0 378 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 CFAP97Q9P2B7 532 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 CPQQ9Y646 472 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa6.88□□□□□ -1.31
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RRN3P1-201ENST00000514813 PDE6CP51160 858 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 COPB1P53618 953 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 GOLGA8FQ08AF8 430 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 ODF2Q5BJF6 829 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM78AQ5JUQ0 283 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 C12orf56Q8IXR9 622 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 SMARCD2Q92925 531 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 ULBP1Q9BZM6 244 aa6.88□□□□□ -1.31
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