RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 WBP2Q969T9 261 aa17.92■□□□□ 0.46
HERC3-211ENST00000513325 CHAMP1Q96JM3 812 aa17.92■□□□□ 0.46
HERC3-211ENST00000513325 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa17.92■□□□□ 0.46
HERC3-211ENST00000513325 USP25Q9UHP3 1055 aa17.92■□□□□ 0.46
HERC3-211ENST00000513325 A0A0A0MRY4 1105 aa17.91■□□□□ 0.46
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HERC3-211ENST00000513325 IKBKBO14920 756 aa17.91■□□□□ 0.46
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HERC3-211ENST00000513325 MAP3K7CLP57077 242 aa17.91■□□□□ 0.46
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HERC3-211ENST00000513325 PMS2CLQ68D20 193 aa17.91■□□□□ 0.46
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HERC3-211ENST00000513325 C11orf74Q86VG3 221 aa17.91■□□□□ 0.46
HERC3-211ENST00000513325 UNC93AQ86WB7 457 aa17.91■□□□□ 0.46
HERC3-211ENST00000513325 BBS7Q8IWZ6 715 aa17.91■□□□□ 0.46
HERC3-211ENST00000513325 NAT16Q8N8M0 369 aa17.91■□□□□ 0.46
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HERC3-211ENST00000513325 NACA2Q9H009 215 aa17.91■□□□□ 0.46
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HERC3-211ENST00000513325 HPSEQ9Y251 543 aa17.91■□□□□ 0.46
HERC3-211ENST00000513325 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa17.91■□□□□ 0.46
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HERC3-211ENST00000513325 CALUO43852 315 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
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HERC3-211ENST00000513325 ADORA2BP29275 332 aa17.9■□□□□ 0.46
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HERC3-211ENST00000513325 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
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HERC3-211ENST00000513325 SPATA32Q96LK8 384 aa17.9■□□□□ 0.46
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HERC3-211ENST00000513325 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa17.9■□□□□ 0.46
HERC3-211ENST00000513325 MYOFQ9NZM1 2061 aa17.9■□□□□ 0.46
HERC3-211ENST00000513325 TLR5O60602 858 aa17.89■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 PRR29P0C7W0 189 aa17.89■□□□□ 0.45
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HERC3-211ENST00000513325 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
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HERC3-211ENST00000513325 TMEM25Q86YD3 366 aa17.89■□□□□ 0.45
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HERC3-211ENST00000513325 RLN3Q8WXF3 142 aa17.89■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 TWNKQ96RR1 684 aa17.89■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 EDEM2Q9BV94 578 aa17.89■□□□□ 0.45
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HERC3-211ENST00000513325 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
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HERC3-211ENST00000513325 TULP3O75386 442 aa17.88■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 TBX18O95935 607 aa17.88■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 FAM200BP0CF97 657 aa17.88■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 NR2F2P24468 414 aa17.88■□□□□ 0.45
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HERC3-211ENST00000513325 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
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HERC3-211ENST00000513325 OLIG1Q8TAK6 271 aa17.88■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 WHAMMQ8TF30 809 aa17.88■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 JAKMIP2Q96AA8 810 aa17.88■□□□□ 0.45
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HERC3-211ENST00000513325 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP17.88■□□□□ 0.45
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HERC3-211ENST00000513325 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 ZDHHC9Q9Y397 364 aa17.88■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 C4orf47A7E2U8 309 aa17.87■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 RHOBTB3O94955 611 aa17.87■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 KIF20AO95235 890 aa17.87■□□□□ 0.45
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HERC3-211ENST00000513325 TRIM49CP0CI26 452 aa17.87■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 PPP3CAQ08209 521 aa17.87■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 INCA1Q0VD86 236 aa17.87■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 CLEC20AQ6ZU45 233 aa17.87■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 CYP2U1Q7Z449 544 aa17.87■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 FRMD1Q8N878 549 aa17.87■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 TAS1R2Q8TE23 839 aa17.87■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 HMGB4Q8WW32 186 aa17.87■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 CYFIP2Q96F07 1278 aa17.87■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 NT5C1AQ9BXI3 368 aa17.87■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
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