RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512069.6

PDE4D-220, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4D, Length 536 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-220ENST00000512069 EPHA3P29320 983 aa5.52□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 UQCRC1P31930 480 aa5.52□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 TPTEP56180 551 aa5.52□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 PROK1P58294 105 aa5.52□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 TFF2Q03403 129 aa5.52□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF750Q32MQ0 723 aa5.52□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 SUMO4Q6EEV6 95 aa5.52□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 UNC13DQ70J99 1090 aa5.52□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 DNAJB14Q8TBM8 379 aa5.52□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 HASPINQ8TF76 798 aa5.52□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 TMEM171Q8WVE6 324 aa5.52□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 SARGQ9BW04 601 aa5.52□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 CPS1P31327 1500 aa5.52□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 GOLGA3Q08378 1498 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 AQP7P3A6NL99 342 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 H7C4K7 107 aa5.51□□□□□ -1.53
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PDE4D-220ENST00000512069 RRP9O43818 475 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 RASAL1O95294 804 aa5.51□□□□□ -1.53
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PDE4D-220ENST00000512069 PRKCGP05129 697 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 ACVR2AP27037 513 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 CTGFP29279 349 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 CPT1AP50416 773 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 TIRAPP58753 221 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 SNX22Q96L94 193 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 BRIP1Q9BX63 1249 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 SERGEFQ9UGK8 458 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 MID2Q9UJV3 735 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 HDAC9Q9UKV0 1011 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 USP22Q9UPT9 525 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 PLA2R1Q13018 1463 aa5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 PTPRKQ15262 1439 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 MYO3AQ8NEV4 1616 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 WIPF3A6NGB9 483 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 F8W8V4 182 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 M0R3H8 397 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 PSMD9O00233 223 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 RGS10O43665 173 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 SRGAP2O75044 1071 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 VNN1O95497 513 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 IL1R2P27930 398 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 GKP32189 559 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 CYP1B1Q16678 543 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 CACHD1Q5VU97 1274 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 PLAG1Q6DJT9 500 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 SIRT6Q8N6T7 355 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 DPF1Q92782 380 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 CTHRC1Q96CG8 243 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 APOL5Q9BWW9 433 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 TRIM36Q9NQ86 728 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 RHPN2P1A8MT19 583 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 RAB27BO00194 218 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 PMPCBO75439 489 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 PIAS2O75928 621 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 IL18RAPO95256 599 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 A1BGP04217 495 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 TRIM27P14373 513 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 TPH1P17752 444 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 PIK3CBP42338 1070 aa5.49□□□□□ -1.53
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PDE4D-220ENST00000512069 CYP4F2P78329 520 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 DAG1Q14118 895 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 PROSER3Q2NL68 480 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 COBLL1Q53SF7 1204 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
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PDE4D-220ENST00000512069 MROH2AA6NES4 1674 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa5.48□□□□□ -1.53
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PDE4D-220ENST00000512069 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-220ENST00000512069 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
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