RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 STKLD1Q8NE28 680 aa12□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 OR6B3Q8NGW1 331 aa12□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 SHC3Q92529 594 aa12□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 PDLIM2Q96JY6 352 aa12□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 KREMEN1Q96MU8 473 aa12□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 PARD6AQ9NPB6 346 aa12□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 CISHQ9NSE2 258 aa12□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa12□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa12□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa12□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 COL4A2P08572 1712 aa12□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 GPR179Q6PRD1 2367 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 LRRC53A6NM62 1247 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 F8VZ95 297 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 MFAP3LO75121 409 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 KRT5P13647 590 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 FERP16591 822 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 CD58P19256 250 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 TGM1P22735 817 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 WARSP23381 471 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 WEE1P30291 646 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 AVPR1AP37288 418 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 GPR15P49685 360 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 ADKP55263 362 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 CDH8P55286 799 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 JAM2P57087 298 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 ARHGAP8P85298 464 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 INCA1Q0VD86 236 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 SDHAF4Q5VUM1 108 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM270Q6UE05 265 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 ADGRF2Q8IZF7 708 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 CMTM8Q8IZV2 173 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 PDCL2Q8N4E4 241 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 MAB21L3Q8N8X9 362 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 BAP1Q92560 729 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 KAT5Q92993 513 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 ARID3AQ99856 593 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 SMYD3Q9H7B4 428 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 GKN1Q9NS71 199 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 TMLHEQ9NVH6 421 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 C2orf42Q9NWW7 574 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 AIPL1Q9NZN9 384 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 L1RE1Q9UN81 338 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 CNTN6Q9UQ52 1028 aa11.99□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 A8MXQ7 604 aa11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 K7ESF4 209 aa11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 HRO43593 1189 aa11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 NRDCO43847 1150 aa11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 CILPO75339 1184 aa11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 RETP07949 1114 aa11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 PAEPP09466 180 aa11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 ACO1P21399 889 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 PCSK1P29120 753 aa11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 RAP1GAPP47736 663 aa11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 PTK2Q05397 1052 aa11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 ARID5BQ14865 1188 aa11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 ASIC2Q16515 512 aa11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 TXNDC8Q6A555 127 aa11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 TRIM68Q6AZZ1 485 aa11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 CEP68Q76N32 757 aa11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 CCDC186Q7Z3E2 898 aa11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM150AQ86TG1 271 aa11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 LONP2Q86WA8 852 aa11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 FAM71AQ8IYT1 594 aa11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 UBR7Q8N806 425 aa11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 TTC16Q8NEE8 873 aa11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 TNIP3Q96KP6 325 aa11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 PANX2Q96RD6 677 aa11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 PPP1R9BQ96SB3 815 aa11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 DNAJC7Q99615 494 aa11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 NT5C1AQ9BXI3 368 aa11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 SDCBP2Q9H190 292 aa11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 ABHD10Q9NUJ1 306 aa11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 KIAA1257Q9ULG3 409 aa11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 CCL26Q9Y258 94 aa11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa11.98□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF292O60281 2723 aa11.97□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 DMDP11532 3685 aa11.97□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 DCDC2BA2VCK2 349 aa11.97□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 GABRDO14764 452 aa11.97□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 MAP3K13O43283 966 aa11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms