RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511439.5

TOPBP1-208, Transcript of DNA topoisomerase II binding protein 1, human

TSL 5

Gene TOPBP1, Length 1,142 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOPBP1-208	ENST00000511439	SCAMP4	Q969E2	229 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	TTC17	Q96AE7	1141 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	GPR35	Q9HC97	309 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	COL4A5	P29400	1685 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	MARCH11	A6NNE9	402 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	CDKL5	O76039	1030 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	RARB	P10826	455 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	HDC	P19113	662 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	CACNB3	P54284	484 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	REST	Q13127	1097 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	DLK2	Q6UY11	383 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	TMIE	Q8NEW7	156 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	ANKS1A	Q92625	1134 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	SARG	Q9BW04	601 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	TEX101	Q9BY14	249 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	RSAD1	Q9HA92	442 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	NARF	Q9UHQ1	456 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	CDH23	Q9H251	3354 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	COL15A1	P39059	1388 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439		A0A1B0GTW7	788 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439		A0A1W2PPL8	197 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	CFAP69	A5D8W1	941 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	UNC119B	A6NIH7	251 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439		E9PLN8	166 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	SMIM22	K7EJ46	135 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	FRS3	O43559	492 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	C1R	P00736	705 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	CFI	P05156	583 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	ELANE	P08246	267 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	FCER1A	P12319	257 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	TRIM27	P14373	513 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	NPR1	P16066	1061 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	PHKA1	P46020	1223 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	SOX8	P57073	446 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	FAM193A	P78312	1265 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	SP3	Q02447	781 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	TP53BP2	Q13625	1128 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	MAP9	Q49MG5	647 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	COLEC12	Q5KU26	742 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	RNF220	Q5VTB9	566 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	CNBD1	Q8NA66	436 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	USP38	Q8NB14	1042 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	IL31RA	Q8NI17	732 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	CDCA5	Q96FF9	252 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	PNKP	Q96T60	521 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	ADAM2	Q99965	735 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	TLR10	Q9BXR5	811 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	WDR26	Q9H7D7	661 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	CPA4	Q9UI42	421 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	MAST3	O60307	1309 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	TONSL	Q96HA7	1378 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TOPBP1-208	ENST00000511439	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		4.35	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms