RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TATDN2Q93075 761 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ACDQ96AP0 544 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CISHQ9NSE2 258 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SCML2Q9UQR0 700 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MYO16Q9Y6X6 1858 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MYOFQ9NZM1 2061 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HHLA1C9JL84 531 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PSMA7O14818 248 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RETP07949 1114 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SEC13P55735 322 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SPEM2Q0P670 501 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GAB4Q2WGN9 574 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SYT13Q7L8C5 426 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HHIPQ96QV1 700 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DUSP16Q9BY84 665 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PNPLA8Q9NP80 782 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CYP26A1O43174 497 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADH5P11766 374 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC6A11P48066 632 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DMC1Q14565 340 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CBWD6Q4V339 395 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C2orf27AQ580R0 203 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CBWD3Q5JTY5 395 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CBWD5Q5RIA9 395 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LY6G5CQ5SRR4 150 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OTUB2Q96DC9 234 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM176AQ96HP8 235 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PNKPQ96T60 521 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAN1B1Q9UKM7 699 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DMXL1Q9Y485 3027 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 K7EQS6 105 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RPP40O75818 363 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TBX18O95935 607 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC192P0DO97 292 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GAB3Q8WWW8 586 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARID3AQ99856 593 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A0A1W2PQH9 124 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AXIN1O15169 862 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 APODP05090 189 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPP1R2P41236 205 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RAD23BP54727 409 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GAD2Q05329 585 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BTBD8Q5XKL5 378 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KLHL10Q6JEL2 608 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BBS7Q8IWZ6 715 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC4A11Q8NBS3 891 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 USP33Q8TEY7 942 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WBP2Q969T9 261 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PARD6AQ9NPB6 346 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OSER1Q9NX31 292 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 COQ4Q9Y3A0 265 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 APBB3O95704 486 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RARGP13631 454 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TGM1P22735 817 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIF11P52732 1056 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LMNB2Q03252 620 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GOLGA8FQ08AF8 430 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP24.58■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ERMP1Q7Z2K6 904 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C12orf40Q86WS4 652 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC33Q8N5R6 958 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NMUR1Q9HB89 426 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CYLDQ9NQC7 956 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARHGEF4Q9NR80 690 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NAGPAQ9UK23 515 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CEP250Q9BV73 2442 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KAT7O95251 611 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CD44P16070 742 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FOXK2Q01167 660 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KDSRQ06136 332 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LRMPQ12912 555 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANO4Q32M45 955 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC40Q4G0X9 1142 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C10orf120Q5SQS8 335 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NAT16Q8N8M0 369 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC35C1Q96A29 364 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SPHK2Q9NRA0 654 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NUDT5Q9UKK9 219 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANTXRLA6NF34 631 aa24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms