RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SH3BP2-209ENST00000504450 NT5C3BQ969T7 300 aa11.26□□□□□ -0.61
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM121Q9BTD3 319 aa11.26□□□□□ -0.61
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SH3BP2-209ENST00000504450 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP11.26□□□□□ -0.61
SH3BP2-209ENST00000504450 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP11.26□□□□□ -0.61
SH3BP2-209ENST00000504450 CACNG4Q9UBN1 327 aa11.26□□□□□ -0.61
SH3BP2-209ENST00000504450 PRDM4Q9UKN5 801 aa11.26□□□□□ -0.61
SH3BP2-209ENST00000504450 ALPK3Q96L96 1907 aa11.26□□□□□ -0.61
SH3BP2-209ENST00000504450 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
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SH3BP2-209ENST00000504450 ALOX15BO15296 676 aa11.25□□□□□ -0.61
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