RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000501011.6

RAB30-AS1-201, Transcript of RAB30 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAB30-AS1, Length 607 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 FAM114A1Q8IWE2 563 aa12.73□□□□□ -0.37
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZSWIM1Q9BR11 485 aa12.73□□□□□ -0.37
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TSPY26PQ9H489 355 aa12.73□□□□□ -0.37
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP12.73□□□□□ -0.37
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SMTNL1A8MU46 457 aa12.72□□□□□ -0.37
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KCNJ18B7U540 433 aa12.72□□□□□ -0.37
RAB30-AS1-201ENST00000501011 M0QYV0 167 aa12.72□□□□□ -0.37
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
RAB30-AS1-201ENST00000501011 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CYP17A1P05093 508 aa12.72□□□□□ -0.37
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HMBSP08397 361 aa12.72□□□□□ -0.37
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
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