RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498399.1

TIMMDC1-209, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TIMMDC1, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-209ENST00000498399 PROM1O43490 865 aa4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 PDHA1P08559 390 aa4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 TSHRP16473 764 aa4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 ITGALP20701 1170 aa4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 TAP2Q03519 686 aa4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 VPS53Q5VIR6 699 aa4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 KIAA0895LQ68EN5 471 aa4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 DEPTORQ8TB45 409 aa4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF384Q8TF68 577 aa4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 PGBD1Q96JS3 809 aa4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 SGCZQ96LD1 299 aa4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 BRIP1Q9BX63 1249 aa4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 ACTRT3Q9BYD9 372 aa4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 TTYH3Q9C0H2 523 aa4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 CERS4Q9HA82 394 aa4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 CPNE5Q9HCH3 593 aa4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 FNIP2Q9P278 1114 aa4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 XPR1Q9UBH6 696 aa4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 RAD54BQ9Y620 910 aa4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 INSRP06213 1382 aa4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 PARD3Q8TEW0 1356 aa4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 PIK3C2GO75747 1445 aa4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZFYVE9O95405 1425 aa4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 TMEM233B4DJY2 109 aa4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 NCK2O43639 380 aa4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 TRIAP1O43715 76 aa4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 C1QL1O75973 258 aa4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 SETSIPP0DME0 302 aa4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 GRIA3P42263 894 aa4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 ELLP55199 621 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 ITIH3Q06033 890 aa4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 BTKQ06187 659 aa4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 LONRF3Q496Y0 759 aa4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 FAM209BQ5JX69 171 aa4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 C1orf228Q6PIY5 440 aa4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 AMIGO2Q86SJ2 522 aa4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 SKAP1Q86WV1 359 aa4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 MICU3Q86XE3 530 aa4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 VPS37AQ8NEZ2 397 aa4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 MORC4Q8TE76 937 aa4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 IQCDQ96DY2 449 aa4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 MOGAT1Q96PD6 335 aa4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 CDK19Q9BWU1 502 aa4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 STK31Q9BXU1 1019 aa4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 ARFGAP3Q9NP61 516 aa4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 PLCB1Q9NQ66 1216 aa4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 SERHLQ9NQF3 203 aa4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 SEMA4GQ9NTN9 838 aa4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC17A6Q9P2U8 582 aa4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 DKK3Q9UBP4 350 aa4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 HESX1Q9UBX0 185 aa4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 PADI4Q9UM07 663 aa4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 COX11Q9Y6N1 276 aa4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 ADGRA2Q96PE1 1338 aa4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 TNRQ92752 1358 aa4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 RIMS2Q9UQ26 1411 aa4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 ERVK-7P63135 1459 aa4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 IQGAP1P46940 1657 aa4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 APOL1O14791 398 aa4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 ORC4O43929 436 aa4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 RASSF9O75901 435 aa4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 NR2F6P10588 404 aa4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 KLRC1P26715 233 aa4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 CD6P30203 668 aa4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF134P52741 427 aa4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 C21orf58P58505 322 aa4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 SATB1Q01826 763 aa4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 TCF15Q12870 199 aa4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 IQCB1Q15051 598 aa4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 PTPRRQ15256 657 aa4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 DCAF12L1Q5VU92 463 aa4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 IZUMO3Q5VZ72 239 aa4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 LAYNQ6UX15 382 aa4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 TMEM108Q6UXF1 575 aa4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 UNC13DQ70J99 1090 aa4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 ATP11CQ8NB49 1132 aa4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 OR56A3Q8NH54 315 aa4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms