RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498219.5

HPS1-214, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 845 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-214ENST00000498219 NMUR1Q9HB89 426 aa15.52■□□□□ 0.08
HPS1-214ENST00000498219 ACP6Q9NPH0 428 aa15.52■□□□□ 0.08
HPS1-214ENST00000498219 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
HPS1-214ENST00000498219 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
HPS1-214ENST00000498219 COMMD8Q9NX08 183 aa15.52■□□□□ 0.08
HPS1-214ENST00000498219 OSER1Q9NX31 292 aa15.52■□□□□ 0.08
HPS1-214ENST00000498219 NUDT5Q9UKK9 219 aa15.52■□□□□ 0.08
HPS1-214ENST00000498219 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa15.52■□□□□ 0.08
HPS1-214ENST00000498219 SIT1Q9Y3P8 196 aa15.52■□□□□ 0.08
HPS1-214ENST00000498219 WNT6Q9Y6F9 365 aa15.52■□□□□ 0.08
HPS1-214ENST00000498219 A0A1W2PQH9 124 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 O00370 1275 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 COCHO43405 550 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 TBX18O95935 607 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 KIF11P52732 1056 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 TPM4P67936 248 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 FANCCQ00597 558 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 TCF15Q12870 199 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 HECTD3Q5T447 861 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 TXNDC11Q6PKC3 985 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 ZNF852Q6ZMS4 543 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 PIGZQ86VD9 579 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 OVCA2Q8WZ82 227 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 FAM3CQ92520 227 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 WBP2Q969T9 261 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 GANQ9H2C0 597 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 LINC00597Q9H2U6 94 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 FBXO44Q9H4M3 255 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 TRPV5Q9NQA5 729 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 SCML2Q9UQR0 700 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 A0A1B0GTH6 734 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 PIK3R2O00459 728 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 MDM4O15151 490 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 OLFM2O95897 454 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 PAEPP09466 180 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 IRF1P10914 325 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 UCHL3P15374 230 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 RGS7P49802 495 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 PDE6CP51160 858 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 ZNF132P52740 706 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 SLC7A9P82251 487 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 PLCB2Q00722 1185 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 RAPGEF1Q13905 1077 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 SCD5Q86SK9 330 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 DTWD2Q8NBA8 298 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 SHC3Q92529 594 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 PNPLA8Q9NP80 782 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 CFAP97Q9P2B7 532 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 HESX1Q9UBX0 185 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 CNTN6Q9UQ52 1028 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 CACNA1HO95180 2353 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 H0Y858 1186 aa15.49■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 M0QYV0 167 aa15.49■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 TLR5O60602 858 aa15.49■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 IFNAR2P48551 515 aa15.49■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 BCAT1P54687 386 aa15.49■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 BST2Q10589 180 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 RUNX3Q13761 415 aa15.49■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 NR1I3Q14994 352 aa15.49■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 PON2Q15165 354 aa15.49■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa15.49■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 FILIP1LQ4L180 1135 aa15.49■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 SNX30Q5VWJ9 437 aa15.49■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 LCLAT1Q6UWP7 414 aa15.49■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 GAS2L3Q86XJ1 694 aa15.49■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 OSCP1Q8WVF1 389 aa15.49■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 ERGIC2Q96RQ1 377 aa15.49■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 ULBP1Q9BZM6 244 aa15.49■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 NACA2Q9H009 215 aa15.49■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 NLRC4Q9NPP4 1024 aa15.49■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 PLCB1Q9NQ66 1216 aa15.49■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 NAGPAQ9UK23 515 aa15.49■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 USP3Q9Y6I4 520 aa15.49■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 WDFY4Q6ZS81 3184 aa15.48■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 MAN2B1O00754 1011 aa15.48■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 RARGP13631 454 aa15.48■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 LCP1P13796 627 aa15.48■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 PFKLP17858 780 aa15.48■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 CTHP32929 405 aa15.48■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 TKTL1P51854 596 aa15.48■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 UBASH3AP57075 661 aa15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms