RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496024.1

CALD1-223, Transcript of caldesmon 1, human

TSL 4

Gene CALD1, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALD1-223	ENST00000496024	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
CALD1-223	ENST00000496024	SCD5	Q86SK9	330 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CALD1-223	ENST00000496024	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CALD1-223	ENST00000496024	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CALD1-223	ENST00000496024	NEK11	Q8NG66	645 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CALD1-223	ENST00000496024	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CALD1-223	ENST00000496024	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CALD1-223	ENST00000496024	IRF7	Q92985	503 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CALD1-223	ENST00000496024	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CALD1-223	ENST00000496024	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CALD1-223	ENST00000496024	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CALD1-223	ENST00000496024	ST7	Q9NRC1	585 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CALD1-223	ENST00000496024	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
CALD1-223	ENST00000496024	OSER1	Q9NX31	292 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CALD1-223	ENST00000496024	OBP2A	Q9NY56	170 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CALD1-223	ENST00000496024	WNT16	Q9UBV4	365 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CALD1-223	ENST00000496024	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CALD1-223	ENST00000496024	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CALD1-223	ENST00000496024	PRR33	A8MZF0	331 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	CHAD	O15335	359 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	GFPT2	O94808	682 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	ZBED1	O96006	694 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	CLCN1	P35523	988 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	KRT9	P35527	623 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	PLA2G4A	P47712	749 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	SOX9	P48436	509 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	ZXDB	P98169	803 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	MTF1	Q14872	753 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	ZNF77	Q15935	545 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	RAB41	Q5JT25	222 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	TAF3	Q5VWG9	929 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	SPAG5	Q96R06	1193 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	STK33	Q9BYT3	514 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	MIS12	Q9H081	205 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	TSPY26P	Q9H489	355 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	EBF3	Q9H4W6	596 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	USP3	Q9Y6I4	520 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024		E7ENQ6	273 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024		F8VZ95	297 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	GABBR2	O75899	941 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	HMBS	P08397	361 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	RALA	P11233	206 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	ARSA	P15289	507 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	PFKL	P17858	780 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	GPD2	P43304	727 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	IFNAR2	P48551	515 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	SLC7A9	P82251	487 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	FANCC	Q00597	558 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	PLCB2	Q00722	1185 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	ARID5A	Q03989	594 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	EFEMP1	Q12805	493 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	USP4	Q13107	963 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	MIB1	Q86YT6	1006 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	FBXL6	Q8N531	539 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	RNF214	Q8ND24	703 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	EDEM1	Q92611	657 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	DNASE1L2	Q92874	299 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	WBP2	Q969T9	261 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	SHD	Q96IW2	340 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	FOXQ1	Q9C009	403 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	ARNTL	O00327	626 aa		10.31	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	CAVIN2	O95810	425 aa		10.31	□□□□□ -0.76
CALD1-223	ENST00000496024	OLFM2	O95897	454 aa		10.31	□□□□□ -0.76

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